Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14639041--14639113
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26
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0
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2
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14685030--14685070
22
1.9
21
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4
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2.0
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18
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30
2.4
30
84
2
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9
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119
1.9
120
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301
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18
100
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6
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0
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0
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0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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41
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0
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38
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22
19
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1.9
22
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19
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1.98
14769326--14769498
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233
23
28
19
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1.98
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28
18
28
1.98
14775445--14775620
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1.9
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219
25
28
18
28
1.98
14780387--14780543
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1
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11
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24
1.91
14780387--14780543
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33
11
30
24
1.91
14780536--14780758
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10
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14780549--14780758
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3.2
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4
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31
10
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14780592--14780808
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3.4
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163
35
11
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1.90
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0
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1
2776
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22
13
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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0
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580
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1
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28
1.92
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1.83
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6
4.3
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100
0
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53
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15
15
1.73
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25
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19
1.27
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1.92
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14875584--14875624
22
1.9
21
85
5
55
48
24
2
24
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14878540--14878569
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14
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0
0
60
0.97
14878540--14878569
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7
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53
40
0
0
60
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25
1.9
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26
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26
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21
2.2
21
84
7
58
50
0
2
47
1.13
14926291--14926347
19
3.1
19
85
12
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35
0
7
57
1.26
14927827--14927853
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
14931866--14931898
2
16.5
2
100
0
66
51
0
48
0
1.00
14936387--14936427
19
2.2
18
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4
55
31
4
14
48
1.65
14939884--14940201
47
6.7
48
74
13
200
24
28
18
28
1.98
14939930--14940198
99
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99
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251
23
27
19
28
1.98
14949616--14949661
18
2.6
18
85
0
65
76
0
2
21
0.90
14957474--14957878
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47
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2
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29
29
8
32
1.87
14957474--14957878
142
2.9
143
92
1
663
29
29
8
32
1.87
14962616--14962653
20
1.9
20
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10
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1.88
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1.92
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96
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1.91
14981358--14981387
12
2.5
12
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0
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10
6
1.62
14981883--14981935
13
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13
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21
51
75
0
18
5
0.99
14981874--14981932
26
2.3
24
81
16
66
76
0
18
5
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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0
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0
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32
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0
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17
26
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1.83
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8
83
11
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45
0
0
54
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18
3.1
20
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15
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1
19
1
77
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0
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22
27
23
1.99
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14
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4
0
38
1.20
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28
21
21
1.99
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0
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21
1.99
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3.0
30
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80
7
92
58
13
17
10
1.62
15022790--15022867
15
5.2
15
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15
16
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1.67
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3.7
46
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13
172
29
29
19
21
1.98
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1.9
93
92
0
292
28
28
20
21
1.98
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2.1
17
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0
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2
0
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28
12
27
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1.9
21
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52
2
35
10
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2.3
44
100
0
204
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16
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1.91
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35
2.0
35
100
0
140
34
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15051819--15051870
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2.2
24
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0
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15
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15057457--15057508
22
2.4
22
81
9
61
13
21
23
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15057512--15057567
22
2.6
21
75
8
58
12
17
17
51
1.75
15058921--15058969
16
3.1
16
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2
55
16
0
12
71
1.14
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14
2.4
14
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0
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33
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27
1.81
15063591--15063624
14
2.4
14
90
0
50
41
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29
1.70
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2.0
13
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0
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38
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49
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0
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3
0
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1.9
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29
14
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40
2.0
40
83
4
101
32
18
28
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345