Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17191870--17191921
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19
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0
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17193963--17194158
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0
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1.44
17200115--17200206
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2.1
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27
28
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66
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1.21
17204563--17204677
19
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18
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20
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1.20
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2.1
36
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21
3.7
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2.0
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1.40
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51
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0
0
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1.65
17207062--17207213
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1.9
81
83
4
198
53
6
15
23
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17207051--17207213
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17217814--17217843
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2.1
14
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0
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0
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2.0
29
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19
2.1
19
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2.2
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29
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20
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20
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0
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20
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0
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2.1
12
100
0
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8
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91
0
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2.8
18
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47
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28
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74
32
0
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57
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34
23
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2.8
24
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8
111
27
20
7
44
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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38
1.50
17258376--17258601
18
12.3
18
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161
47
12
1
38
1.50
17258395--17258601
71
2.8
71
77
11
193
48
12
1
37
1.50
17258404--17258625
114
1.9
114
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313
47
12
1
38
1.50
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0
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0
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1
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1.12
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20
20
1.96
17287802--17287909
37
2.9
36
80
14
107
39
1
3
54
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17287802--17287877
12
6.8
11
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19
52
40
1
2
55
1.22
17295602--17295650
20
2.6
19
78
12
57
40
2
4
53
1.32
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2.1
19
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25
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0
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10
19
1.77
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21
2.4
21
86
0
73
4
50
18
28
1.65
17311088--17311116
13
2.1
14
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55
10
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34
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18
2.1
18
100
0
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21
15
23
39
1.92
17316210--17316328
9
13.4
9
79
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127
32
0
19
47
1.56
17316210--17316395
27
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27
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16
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37
1
13
46
1.54
17316497--17316535
17
2.4
17
87
8
55
28
0
0
71
0.86
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24
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24
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3
3
43
1.38
17320262--17320296
16
2.1
16
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5
52
65
5
0
28
1.15
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16
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16
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1.53
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7
5.0
7
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41
0
16
1.48
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1.49
17320774--17320894
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14
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47
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1.52
17321298--17321386
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40
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23
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23
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0
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27
4
22
45
1.72
17324394--17324445
20
2.6
20
90
0
86
51
0
25
23
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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15
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30
22
23
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17338168--17338228
30
2.1
29
84
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3
1
36
1.24
17341942--17342131
28
6.6
29
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215
26
14
23
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1.94
17344055--17344164
26
4.2
26
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0
184
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26
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1.92
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1.9
25
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0
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19
21
24
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182
2.0
182
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0
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1.94
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0
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2.0
15
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27
0
20
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0
0
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17
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206
24
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19
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17378387--17378557
90
1.9
90
85
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236
25
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19
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17380705--17380780
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2.1
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52
2.7
55
78
3
161
20
22
19
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17386248--17386356
53
2.1
53
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0
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30
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4
109
16
41
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36
1.71
17391552--17391643
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15
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73
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4
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203
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0
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5
6.8
5
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0
50
5
14
58
20
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345