Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  35  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9962410--9962460
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13
82
12
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1
15
0
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0
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21
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0
4
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1.12
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12
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0
0
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15
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0
0
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0.94
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5.5
18
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11
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1.77
9968762--9968866
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2.0
23
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19
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22
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22
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1
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0
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0
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0
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0
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0
88
0.50
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4.9
19
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15
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2.5
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12
99
35
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11
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9978954--9979026
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4.1
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20
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35
16
10
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1.9
30
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0
78
28
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21
28
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2.2
21
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0
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25
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2.7
17
86
0
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47
10
10
30
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9985194--9985310
30
3.9
30
80
5
114
43
4
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30
1.72
9985580--9985960
54
7.1
54
89
4
574
37
17
15
29
1.91
9985580--9985960
110
3.5
108
90
4
583
37
17
15
29
1.91
9985580--9985960
164
2.4
159
91
4
595
37
17
15
29
1.91
9985939--9985973
14
2.5
14
95
0
61
60
0
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22
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9985904--9986205
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10
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20
17
26
1.95
9986143--9986281
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1.9
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2
210
29
20
17
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1.95
9986143--9986728
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7.9
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13
334
30
19
17
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1.95
9986299--9987033
212
3.4
216
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13
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20
16
29
1.95
9986278--9986789
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6.9
76
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711
31
20
16
31
1.95
9986737--9986847
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58
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188
30
28
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1.96
9986586--9987001
210
2.0
205
86
9
588
32
22
16
28
1.96
9986797--9986958
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1.9
85
96
2
301
35
18
16
29
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9986872--9987033
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2.3
71
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6
256
34
20
17
27
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14
2.2
15
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5
57
0
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3
78
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5.1
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10
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9994416--9994531
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4.0
29
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117
43
0
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32
1.59
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2.2
21
92
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76
36
17
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41
1.69
10002033--10002073
20
2.0
20
100
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36
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1.73
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26
2.5
26
97
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29
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28
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10010399--10010431
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2.2
15
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0
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45
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9
39
1.61
10015673--10015702
15
2.0
15
100
0
60
26
0
6
66
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10016265--10016316
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16
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0
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0
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0
0
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0
0
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2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
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20
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2
43
1.38
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90
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446
48
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2
44
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1.9
19
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0
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4
48
1.34
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2.0
17
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52
45
0
0
54
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10023414--10023468
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50
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0
95
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1.57
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0
0
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2
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1
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1.18
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29
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2
3
58
1.29
10034285--10034669
19
20.8
18
66
21
101
33
2
3
60
1.29
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3.3
22
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1
5
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1.27
10034554--10034650
8
11.0
8
70
18
52
32
4
2
60
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10038198--10038298
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2.4
42
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5
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31
19
18
29
1.96
10038179--10038334
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3.7
43
71
10
131
30
23
19
27
1.98
10038187--10038342
85
1.8
85
83
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30
22
19
27
1.98
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2.7
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8
142
29
23
19
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1.98
10045886--10046048
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1.9
85
82
7
206
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23
17
27
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2.4
90
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4
281
38
21
9
30
1.85
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17
8.4
17
77
8
130
47
10
11
30
1.74
10053612--10053774
35
4.7
35
79
6
170
47
10
12
30
1.74
10053953--10053999
20
2.5
19
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16
53
44
8
17
29
1.78
10053992--10054039
24
2.1
24
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7
64
29
2
10
58
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10054164--10054214
11
4.5
11
78
9
50
68
5
0
25
1.12
10054165--10054206
22
1.9
22
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0
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7
0
21
1.09
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0
21
0
78
0.75
10054351--10054410
22
2.8
20
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14
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0
21
0
78
0.75
10054355--10054401
14
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0
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0
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0
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3
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3
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0
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4.1
29
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20
31
1.68
10055200--10055234
14
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15
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4
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25
0
2
71
1.00
10055476--10055685
54
3.9
54
84
9
288
36
18
15
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10055476--10055678
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1.9
105
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4
320
35
18
15
30
1.92
10055951--10055984
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2.1
16
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0
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17
1.45
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2.9
88
82
9
315
37
18
18
26
1.93
10055968--10056284
123
2.6
123
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2
539
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27
1.92
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191
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1
2234
35
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13
30
1.91
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2.0
73
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4
211
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20
13
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1.92
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2.8
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9
203
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13
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1.90
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14
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1.93
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30
1.73
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35
4.7
35
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179
47
10
11
30
1.74
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17
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10
149
47
10
11
29
1.73
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20
2.5
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1.78
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1
0
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0
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0
19
0
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11
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0
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0.95
10066483--10066528
24
2.0
24
91
4
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0
36
0
63
0.95
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10
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0
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10066483--10066528
13
3.7
13
81
18
62
0
36
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10066896--10067012
30
3.9
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21
30
1.69
10066911--10067012
30
3.4
30
82
2
125
44
3
21
30
1.70
10070340--10070368
15
2.0
15
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29
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1
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64
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1.9
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179
26
17
5
50
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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