Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  345  ( 41358 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3540854--3540888
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2.0
18
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54
5
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1.54
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2.4
18
88
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70
45
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2
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2.6
19
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33
2
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47
1.58
3575607--3575699
43
2.2
43
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3576703--3576742
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2.2
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2.0
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2.0
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20
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19
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20
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2.0
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85
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57
14
17
4
63
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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82
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15
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20
4.0
20
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5
79
20
12
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1.57
3606306--3606393
40
2.2
40
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20
12
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1.61
3611361--3611390
16
1.9
15
93
6
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56
20
3
20
1.56
3612941--3612982
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17
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17
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54
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2
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3613147--3613184
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0
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0
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0
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0
0
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11
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2.0
34
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13
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2
5
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1.42
3632054--3632121
31
2.2
32
84
7
86
48
10
2
38
1.52
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2.0
26
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5
0
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29
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30
82
10
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45
5
7
42
1.53
3643576--3643640
29
2.2
30
78
8
71
43
4
7
44
1.53
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125
2.0
125
98
0
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2.5
51
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5
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35
15
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26
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31
4.8
31
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3
219
26
18
29
25
1.98
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42
2.7
42
80
6
135
31
13
26
28
1.94
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21
2.8
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90
34
27
24
13
1.93
3648577--3648659
21
3.8
23
81
9
84
37
25
22
14
1.92
3649034--3649072
15
2.6
14
84
11
51
53
12
0
33
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.1
16
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2
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1
37
35
1.64
3650240--3650321
33
2.5
32
96
2
146
25
1
37
35
1.64
3650302--3650392
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2.0
45
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2
121
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6
28
37
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2.0
17
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52
54
0
0
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2
43
1.42
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3.2
66
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18
204
46
7
2
43
1.44
3650540--3651523
359
2.7
360
95
1
1758
47
6
2
43
1.42
3650540--3651523
479
2.0
482
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1
1771
47
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2
43
1.42
3653562--3653671
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3.3
33
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11
127
31
9
17
41
1.80
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1
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28
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2.4
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2
11
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1.54
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2.1
25
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0
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40
15
7
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1.76
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1.9
25
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13
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2
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1.31
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1.56
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15
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1.04
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0
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3
84
4
53
33
8
0
58
1.28
3670382--3670438
3
19.3
3
79
16
66
33
3
0
63
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3671597--3671639
8
5.2
8
84
15
61
25
0
0
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0.82
3671597--3671639
18
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16
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25
0
0
74
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6
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0
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24
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76
26
26
20
27
1.99
3699638--3699694
26
2.1
27
80
6
62
33
5
1
59
1.30
3700103--3700167
29
2.2
31
88
5
98
36
9
0
53
1.33
3701268--3701347
42
1.9
42
94
0
142
38
17
11
32
1.85
3702043--3702782
368
2.0
368
100
0
1480
33
14
16
35
1.90
3704371--3704436
13
5.1
13
81
7
89
30
9
22
37
1.85
3710977--3711027
25
2.0
25
96
0
93
47
3
17
31
1.66
3717616--3717676
31
2.0
31
90
0
95
32
18
3
45
1.65
3728517--3728546
12
2.4
13
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5
53
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26
10
33
1.89
3732704--3732728
6
4.2
6
100
0
50
16
32
0
52
1.44
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27
2.4
28
78
10
78
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0
11
17
1.14
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26
2.2
26
83
6
69
75
0
10
14
1.06
3755328--3755389
30
2.1
30
96
0
115
32
11
24
32
1.90
3757768--3757851
31
2.7
30
77
1
87
41
16
9
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3761312--3761457
74
2.0
74
86
5
206
41
27
13
17
1.86
3761751--3761804
15
3.9
14
76
14
58
38
11
9
40
1.73
3764928--3764978
21
2.4
22
90
3
77
13
15
11
58
1.63
3764928--3764983
22
2.6
21
88
2
76
14
14
10
60
1.58
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18
2.7
16
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15
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32
0
8
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1.28
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18
2.7
18
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9
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43
0
2
54
1.12
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2.0
22
100
0
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9
13
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1.76
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9
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9
100
0
50
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0
0
40
0.97
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6
5.5
6
100
0
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15
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18
33
1.92
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18
2.2
18
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0
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12
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20
32
1.90
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11
2.5
11
100
0
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0
28
28
1.56
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25
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25
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1
248
20
26
20
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1.97
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22
2.8
22
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6
85
15
26
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1.92
3791344--3791447
46
2.2
49
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5
133
27
15
26
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1.96
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22
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20
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0
0
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1.00
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2.6
30
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9
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0
44
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17
2.1
17
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0
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0
0
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1.00
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24
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51
1
1
45
1.20
3807995--3808033
17
2.5
17
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16
57
64
0
0
35
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15
2.8
16
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7
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37
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2
51
1.47
3810188--3810230
22
2.0
22
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9
52
34
13
13
37
1.85
3815991--3816062
36
2.0
36
97
0
135
27
15
11
45
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3817715--3818222
173
3.0
172
80
9
626
31
14
21
32
1.93
3817715--3818197
166
2.9
166
80
8
548
31
14
21
31
1.94
3828661--3828811
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
3841416--3841474
31
1.9
31
82
0
73
33
13
13
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1.9
28
100
0
108
50
7
12
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1.9
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5
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0
0
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2
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0
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15.7
3
86
0
67
40
0
0
59
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345