Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  100  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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100
0
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0
10
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Indices
Period
Size
Copy
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Score
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28
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12
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33128500--33129291
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1.00
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96
28
24
7
40
1.81
33136488--33136584
30
3.2
30
74
8
108
27
25
17
28
1.98
33138282--33138327
13
3.6
13
85
5
67
71
8
10
8
1.30
33139225--33139295
37
1.9
37
86
11
101
76
2
18
2
1.04
33139235--33139284
6
8.2
6
83
14
50
76
2
20
2
0.99
33141481--33141577
30
3.2
30
75
2
106
27
26
16
28
1.97
33151926--33151979
14
3.8
14
76
11
56
1
22
1
74
1.02
33155730--33156025
47
6.3
47
94
0
502
32
9
30
28
1.88
33156144--33156222
37
2.1
37
86
4
106
25
17
30
26
1.97
33158129--33158202
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
33160151--33160228
29
2.7
28
84
11
104
25
15
30
28
1.96
33161758--33161848
39
2.3
40
86
7
123
26
20
28
24
1.99
33161785--33161979
40
4.9
40
82
1
196
24
22
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33166246--33166272
4
6.8
4
100
0
54
22
0
0
77
0.76
33173187--33173230
23
1.9
24
86
9
65
13
20
4
61
1.50
33175494--33175560
14
4.8
14
74
9
57
16
4
4
74
1.14
33175497--33175561
13
4.8
14
79
7
62
13
4
6
75
1.15
33178235--33178682
47
9.4
47
93
1
725
32
8
29
29
1.87
33178801--33178879
37
2.1
37
84
9
99
25
16
30
27
1.97
33187110--33187162
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
33190624--33190718
27
3.4
27
70
25
63
66
2
24
7
1.28
33192471--33192530
29
2.1
29
96
0
111
41
31
0
26
1.56
33192477--33192524
15
3.3
15
76
5
62
43
29
0
27
1.55
33192759--33192837
11
7.3
11
69
26
53
67
7
6
18
1.38
33192790--33192834
13
3.7
12
88
5
56
60
8
8
22
1.55
33193966--33194114
39
3.8
40
87
3
139
26
30
22
20
1.98
33193999--33194124
39
3.2
39
94
0
207
27
30
20
21
1.98
33200800--33200843
22
2.0
22
100
0
88
27
36
4
31
1.77
33201258--33201354
30
3.2
30
75
2
106
27
26
16
28
1.97
33203537--33203575
20
2.0
20
85
10
53
33
7
0
58
1.26
33210935--33210969
18
1.9
18
88
11
54
22
20
0
57
1.41
33210994--33211047
6
9.2
6
75
4
56
3
14
5
75
1.12
33212007--33212052
11
4.3
11
91
2
58
13
6
4
76
1.14
33212129--33212160
11
2.8
12
95
4
57
6
3
6
84
0.86
33215270--33215324
20
2.8
20
85
0
74
25
27
16
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33215826--33215967
70
2.2
63
83
13
166
40
12
23
23
1.89
33215847--33215983
70
2.0
70
95
0
247
35
12
25
27
1.92
33217133--33217165
12
2.7
13
86
13
52
75
6
3
15
1.11
33218194--33218225
15
2.1
16
94
5
57
71
0
21
6
1.07
33218924--33218978
20
2.8
20
88
0
83
25
29
16
29
1.97
33219480--33219621
70
2.2
63
83
13
166
40
12
23
23
1.89
33219501--33219637
70
2.0
70
95
0
247
35
12
25
27
1.92
33227814--33227867
24
2.2
25
78
15
60
11
22
3
62
1.43
33230118--33230146
14
2.1
14
100
0
58
13
6
6
72
1.26
33233191--33233287
30
3.2
30
75
2
106
27
26
16
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311