Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  294  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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Period
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
93
0
53
45
0
3
51
1.17
95911732--95911772
18
2.3
18
87
4
57
34
0
4
60
1.18
95911857--95911925
34
2.0
34
83
10
88
55
4
0
40
1.20
95923568--95923748
94
1.9
94
89
2
283
29
16
11
42
1.83
95923937--95924021
23
3.9
23
70
27
85
50
1
25
22
1.56
95924168--95924242
37
2.0
38
84
2
98
58
2
9
29
1.43
95924110--95924221
51
2.2
50
82
9
127
61
2
5
30
1.32
95924265--95924359
43
2.2
43
81
5
104
43
2
15
38
1.59
95924461--95924539
33
2.3
35
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6
128
32
2
8
55
1.44
95925094--95925162
36
1.9
36
84
0
93
53
11
7
27
1.63
95927415--95927447
17
1.9
17
100
0
66
27
18
24
30
1.98
95927651--95927730
41
2.0
40
92
2
133
46
11
7
35
1.68
95928062--95928095
16
2.2
16
89
5
52
41
2
0
55
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95928945--95928987
22
1.9
22
85
4
59
37
6
2
53
1.41
95932083--95932116
13
2.4
15
90
9
54
64
0
0
35
0.94
95932680--95932724
23
2.0
23
86
8
65
75
4
0
20
0.97
95932697--95932728
17
1.9
17
93
6
57
75
3
0
21
0.95
95932682--95932724
15
2.8
16
82
6
54
74
4
0
20
1.00
95939066--95939110
18
2.5
18
81
0
54
55
0
0
44
0.99
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8
365
21
24
14
39
1.90
95942275--95942350
38
2.0
38
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0
143
22
23
14
39
1.91
95942041--95942384
130
2.6
135
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6
423
21
23
14
39
1.91
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25
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15
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4
8
30
1.49
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22
1.9
22
90
0
66
61
7
2
28
1.35
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16
2.4
16
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0
51
43
28
5
23
1.75
95946225--95946278
18
3.3
18
66
28
57
20
7
50
22
1.73
95946221--95946349
30
4.3
30
94
0
222
17
6
50
25
1.69
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2.0
21
90
0
66
28
28
9
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1.88
95947227--95947580
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3.9
90
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8
375
37
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27
1.93
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73
8.0
73
85
8
750
32
20
16
30
1.95
95947489--95948074
221
2.7
221
91
4
915
32
20
16
30
1.95
95948264--95948308
13
3.4
13
87
6
72
68
6
11
13
1.37
95948079--95948450
100
3.8
101
83
8
431
38
19
17
24
1.93
95948277--95948450
89
2.0
86
86
5
242
36
20
18
24
1.95
95960216--95960270
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95960344--95960393
25
2.0
26
84
11
68
58
6
4
32
1.41
95960358--95960399
22
1.9
22
90
0
66
61
7
2
28
1.35
95960415--95960545
23
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25
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13
109
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6
35
1.40
95960409--95960543
46
2.9
47
75
8
132
57
2
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33
1.38
95961019--95961072
18
3.3
18
66
28
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20
7
50
22
1.73
95961015--95961082
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2.3
30
97
0
127
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12
100
0
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0
0
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1.9
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1
244
47
14
19
18
1.83
95985273--95985497
122
1.9
120
85
3
317
41
9
18
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311