Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  280  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
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Score
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74
38
16
9
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91842309--91842371
18
3.5
18
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1.78
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2.2
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257
29
20
22
27
1.99
91848564--91848604
20
2.0
20
90
9
66
9
9
0
80
0.91
91849520--91849554
3
11.7
3
100
0
70
34
31
0
34
1.58
91851922--91852418
46
10.8
46
93
0
744
39
14
24
21
1.91
91853262--91853305
17
2.6
18
82
10
56
34
11
2
52
1.50
91853991--91854049
28
2.1
28
81
9
68
35
6
1
55
1.36
91854003--91854066
28
2.4
26
82
10
76
31
4
3
60
1.32
91858024--91858054
16
1.9
16
93
0
53
48
9
6
35
1.62
91858198--91858236
21
1.9
21
89
5
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30
0
7
61
1.24
91868205--91868230
3
8.7
3
100
0
52
69
0
30
0
0.89
91871164--91871225
30
2.1
31
81
6
74
45
14
4
35
1.66
91872029--91872074
19
2.4
19
86
13
60
56
2
2
39
1.24
91877283--91877311
3
9.7
3
100
0
58
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91889608--91889655
17
2.8
17
70
0
51
35
0
0
64
0.94
91889852--91889895
20
2.3
19
84
11
54
22
0
6
70
1.11
91890603--91890640
20
2.0
20
89
5
60
55
0
0
44
0.99
91890831--91890877
20
2.4
19
80
16
51
31
2
4
61
1.27
91893904--91893951
24
2.0
24
84
8
62
18
6
14
60
1.55
91897927--91897972
23
2.0
23
83
8
58
52
0
6
41
1.27
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7
3.7
7
100
0
52
42
11
0
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1.40
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14
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15
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41
2
0
56
1.11
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2.0
47
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0
143
35
7
17
40
1.77
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35
2.2
35
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11
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42
10
3
42
1.57
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31
1.9
31
100
0
120
31
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38
1.81
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60
2.2
59
78
6
136
40
16
5
36
1.72
91912681--91912711
14
2.2
14
94
0
53
54
3
0
41
1.16
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28
3.3
28
70
13
89
35
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20
28
1.93
91919750--91919784
18
2.0
18
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5
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60
0
0
40
0.97
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9
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9
90
0
53
58
0
3
38
1.15
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2.1
27
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70
1
3
24
1.13
91921650--91921709
31
1.9
31
83
6
77
35
8
10
46
1.67
91929434--91929496
26
2.4
26
76
12
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50
1
3
44
1.27
91929720--91929761
16
2.6
16
92
3
66
33
16
4
45
1.69
91938276--91938304
15
1.9
15
100
0
58
34
0
20
44
1.52
91938313--91938360
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91938377--91938465
42
2.1
42
93
0
151
30
5
12
51
1.62
91942259--91942306
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
91942323--91942411
42
2.1
42
93
0
151
30
5
12
51
1.62
91949559--91949618
22
2.6
23
71
15
61
40
0
6
53
1.27
91949649--91949693
23
2.0
23
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16
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0
0
53
1.00
91950405--91950446
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0
0
52
1.00
91950408--91950446
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1.9
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46
0
0
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1.00
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5
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14
1.28
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3
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14
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63
1
4
30
1.25
91951663--91951692
11
2.6
11
94
5
51
73
0
0
26
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311