Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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11
3
37
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95105012--95105086
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0
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6
6
45
1.55
95160440--95160774
167
2.0
167
97
0
634
34
5
19
40
1.75
95161964--95162061
32
3.1
31
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7
117
39
16
15
28
1.89
95163862--95163900
18
2.2
18
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4
53
35
28
0
35
1.58
95165814--95165847
15
2.3
15
100
0
68
44
0
0
55
0.99
95166095--95166155
19
3.1
19
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23
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4
3
50
1.40
95172559--95172610
19
2.8
18
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19
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1
0
51
1.12
95172572--95172601
15
2.0
15
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0
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0
0
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0
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33
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2.0
52
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0
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1.96
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53
2.0
52
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1
147
39
7
10
42
1.68
95229940--95229983
11
3.8
11
80
11
52
31
0
4
63
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
209
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0
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45
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20
23
1.83
95232704--95232784
40
2.0
39
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50
3
2
43
1.33
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17
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0
2
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0.90
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14
2.0
15
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10
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0
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2.0
20
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0
7
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25
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1
0
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0
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0
0
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0
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0
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0
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70
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0
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25
25
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0
1.52
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24
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0
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22
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1.30
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2.5
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2
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14
76
7
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17
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0
0
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95297801--95297854
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25
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5.1
18
82
0
110
34
14
21
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95311175--95311265
36
2.5
36
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0
128
34
14
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29
1.93
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3.0
21
92
0
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4
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1.61
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100
0
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0
0
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20
2.0
20
85
10
53
66
7
23
2
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311