Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  197  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67873138--67873314
54
3.3
54
81
6
205
29
28
15
26
1.96
67881194--67881368
27
6.5
27
85
1
181
29
28
15
26
1.96
67881194--67881369
54
3.3
54
83
4
212
29
27
15
27
1.96
67889198--67889375
27
6.6
27
82
3
115
29
28
15
26
1.96
67889219--67889374
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
67889198--67889374
54
3.3
54
81
6
205
29
28
15
26
1.96
67900362--67900474
40
2.8
40
90
1
127
23
20
29
27
1.99
67900377--67900492
40
2.9
40
94
0
196
19
22
30
27
1.98
67900490--67900585
43
2.2
43
79
3
104
13
22
30
33
1.93
67900704--67900749
23
2.0
23
91
8
76
28
13
32
26
1.93
67900740--67900840
28
3.5
28
70
10
96
20
20
29
28
1.98
67900744--67900865
58
2.1
58
95
0
217
18
18
32
30
1.95
67900744--67900837
30
3.2
30
67
11
95
20
19
29
30
1.97
67900768--67900867
28
3.5
28
70
15
87
18
19
35
28
1.94
67929150--67929333
67
2.8
64
73
8
167
30
17
29
22
1.97
67934458--67934554
30
3.2
30
81
10
99
57
14
17
10
1.64
67934466--67934545
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
67934477--67934554
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
67938076--67938244
47
3.6
47
79
4
162
30
27
16
25
1.97
67949409--67949526
44
2.7
44
88
2
139
31
16
20
32
1.94
67949428--67949534
44
2.4
44
93
0
178
31
16
22
28
1.96
67956027--67956187
55
3.0
53
74
9
137
20
22
19
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67956919--67957015
11
8.8
11
84
0
113
52
34
10
3
1.51
67966545--67966711
46
3.6
46
74
9
169
30
30
19
19
1.96
67966553--67966724
93
1.8
93
88
2
265
29
30
19
20
1.97
67966797--67967064
46
5.8
45
72
15
215
31
28
17
22
1.97
67966850--67967005
47
3.3
47
74
15
178
32
30
16
21
1.95
67966803--67967068
93
2.9
93
93
0
451
30
28
18
22
1.97
67970157--67970211
15
3.8
14
74
9
56
60
16
14
9
1.59
67970158--67970214
30
1.9
29
92
3
96
57
15
15
10
1.64
67976426--67976710
48
6.0
47
92
4
484
31
8
30
30
1.86
67976426--67976708
95
3.0
94
94
4
489
31
8
30
30
1.86
67976879--67976956
36
2.1
37
88
6
115
25
19
30
24
1.98
67978312--67978544
47
5.0
47
90
1
360
36
12
25
25
1.91
67978571--67978665
46
2.1
46
85
0
127
31
6
31
30
1.82
67981431--67981698
46
5.8
46
75
16
266
27
29
21
21
1.99
67981439--67981701
93
2.8
93
93
0
445
27
28
22
21
1.99
67981491--67981652
47
3.5
47
75
17
174
27
29
21
22
1.99
67984415--67984469
15
3.8
14
74
9
56
60
16
12
10
1.60
67984416--67984472
30
1.9
29
92
3
96
57
15
14
12
1.65
67987419--67987592
46
3.7
47
72
15
155
32
27
18
21
1.96
67987472--67987641
47
3.6
47
68
16
136
31
26
18
23
1.98
67987427--67987691
93
2.9
94
85
4
360
30
27
19
23
1.98
67989161--67989343
40
4.6
40
88
2
253
27
27
23
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67993090--67993126
20
1.9
19
89
10
58
48
16
16
18
1.81
67998083--67998258
48
3.7
48
88
0
253
23
18
32
25
1.97
67998084--67998258
96
1.8
96
91
0
287
22
18
32
25
1.97
67998086--67998304
96
2.3
96
83
1
251
25
18
30
26
1.98
68001379--68001451
35
2.1
35
97
0
137
36
5
17
39
1.73
68002636--68002677
17
2.5
17
80
11
50
33
0
19
47
1.49
68002848--68002983
43
3.2
43
93
0
227
11
22
34
30
1.90
68003140--68003239
29
3.4
29
68
10
87
24
21
25
30
1.99
68003169--68003323
29
5.4
29
70
11
113
22
18
30
27
1.97
68003227--68003323
28
3.4
28
73
7
88
20
18
34
26
1.96
68003137--68003305
58
2.9
58
93
0
286
23
19
28
28
1.98
68007242--68007314
35
2.1
35
97
0
137
36
5
17
39
1.73
68014734--68014771
12
2.9
13
80
11
51
47
0
15
36
1.46
68014777--68014829
21
2.7
19
71
8
52
64
5
3
26
1.33
68014822--68014923
10
10.6
10
69
16
56
64
0
4
29
1.20
68014871--68014903
17
1.9
17
93
0
57
57
0
6
36
1.23
68034755--68034940
49
3.5
50
77
15
205
25
18
26
29
1.98
68038015--68038047
15
2.2
15
94
0
57
18
12
12
57
1.64
68040810--68041037
49
4.6
49
82
3
285
24
17
28
29
1.97
68042722--68042984
48
5.4
48
77
3
249
29
18
25
26
1.98
68042714--68043000
98
2.9
97
85
1
369
31
18
24
26
1.97
68044515--68044616
28
3.7
27
73
8
89
27
31
14
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68044833--68044867
16
2.2
16
89
0
52
17
20
17
45
1.85
68048234--68048357
43
2.9
42
80
5
133
48
3
19
29
1.64
68051797--68052046
134
1.9
133
86
4
360
36
24
17
21
1.95
68053333--68053401
33
2.1
34
94
2
122
52
2
31
13
1.55
68054632--68054656
11
2.3
11
100
0
50
36
20
16
28
1.93
68056834--68057160
48
6.8
48
81
4
363
27
19
28
24
1.99
68056893--68057163
144
1.9
145
91
2
447
26
19
28
25
1.99
68073501--68073559
30
2.0
30
86
0
82
40
6
22
30
1.79
68073937--68074304
48
7.7
48
82
2
319
26
20
28
24
1.99
68073937--68074303
96
3.8
96
79
7
393
26
20
28
24
1.99
68073939--68074303
144
2.5
143
83
2
419
26
20
28
24
1.99
68082372--68082522
40
3.8
39
87
4
196
23
25
28
22
1.99
68084078--68084126
22
2.2
23
85
10
66
36
6
2
55
1.37
68091170--68091487
48
6.6
48
75
6
261
23
27
21
27
1.99
68091170--68091502
96
3.5
95
81
6
345
24
27
20
27
1.99
68091170--68091489
144
2.2
142
81
2
372
23
27
21
27
1.99
68093487--68093692
114
1.8
114
82
4
272
33
18
20
27
1.96
68094246--68094486
120
2.0
120
97
0
455
38
12
9
39
1.77
68094821--68094872
15
3.5
15
73
7
52
44
44
0
11
1.40
68094915--68094967
22
2.5
22
78
9
65
54
24
0
20
1.44
68098151--68098204
27
2.0
27
100
0
108
51
11
0
37
1.37
68098159--68098203
14
3.3
14
72
27
51
51
13
0
35
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68098192--68098241
9
5.6
9
88
9
66
42
22
2
34
1.65
68099131--68099271
31
4.5
31
92
0
219
31
26
15
26
1.96
68099478--68099534
24
2.4
25
82
11
75
28
19
21
31
1.97
68099478--68099585
25
4.4
24
80
6
74
26
22
23
27
1.99
68099491--68099584
25
3.8
25
85
1
127
26
22
25
25
2.00
68100599--68100806
80
2.6
81
86
3
269
28
7
21
42
1.79
68100488--68100958
27
17.4
27
80
4
241
33
8
20
37
1.83
68106946--68106974
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
68107388--68107439
27
2.0
26
81
11
61
26
19
50
3
1.65
68107659--68107737
31
2.5
33
83
8
108
11
8
21
58
1.60
68107679--68107737
31
1.9
31
96
0
109
11
11
23
52
1.71
68107827--68107923
43
2.2
43
85
5
124
23
29
19
26
1.98
68110743--68110794
20
2.6
20
78
0
68
17
32
28
21
1.96
68112514--68112802
48
5.9
47
74
11
183
24
28
20
25
1.99
68112517--68112806
96
3.0
95
82
6
334
24
29
20
25
1.99
68112520--68112802
144
2.0
145
80
5
322
24
28
20
26
1.99
68121628--68121689
26
2.4
26
89
2
90
17
27
4
50
1.67
68127905--68127988
40
2.1
40
88
4
125
25
22
28
23
1.99
68131861--68131912
22
2.4
22
93
3
88
57
3
15
23
1.54
68135274--68135382
46
2.3
47
82
7
132
11
27
13
47
1.77
68142479--68142585
47
2.3
47
84
11
130
13
29
8
48
1.71
68142858--68142899
21
2.0
21
100
0
84
23
9
28
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68147213--68147273
25
2.5
25
83
2
79
32
19
19
27
1.96
68149491--68149673
39
4.7
39
89
0
285
22
26
20
29
1.99
68157332--68157551
39
5.6
39
91
0
341
24
27
19
28
1.98
68159707--68159832
42
2.9
44
78
4
139
29
26
18
25
1.98
68170572--68171038
48
9.8
48
75
1
398
26
18
27
27
1.98
68170568--68171038
96
4.9
96
87
0
674
26
18
27
27
1.98
68170568--68171038
191
2.5
192
89
0
710
26
18
27
27
1.98
68174177--68174305
47
2.8
46
78
13
147
25
18
30
25
1.98
68174219--68174312
48
2.0
46
89
4
143
25
18
31
24
1.97
68174177--68174350
46
3.7
46
79
11
144
27
17
29
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311