Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  253  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84486989--84487056
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23
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55
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.2
222
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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0
0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
84684535--84684582
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2
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1.11
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2.0
27
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76
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1
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1.28
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26
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2.0
23
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2
6
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1.34
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2
670
26
23
18
31
1.97
84700193--84700959
132
5.9
133
72
8
468
26
24
18
30
1.98
84700170--84700959
88
9.1
88
80
3
477
26
24
17
30
1.97
84700850--84701122
147
1.8
149
88
4
426
28
23
17
30
1.97
84701028--84701755
130
5.6
129
81
1
812
26
22
20
30
1.98
84700700--84701255
277
2.0
277
90
1
864
27
23
18
30
1.98
84701028--84701755
260
2.8
259
83
2
938
26
22
20
30
1.98
84700984--84701754
44
17.8
44
67
9
226
26
23
19
30
1.98
84701029--84701755
390
1.9
390
83
3
944
25
22
20
30
1.98
84703676--84703708
16
2.1
16
88
11
50
63
12
12
12
1.52
84712128--84712168
20
2.0
20
95
0
73
41
12
0
46
1.41
84712308--84712336
13
2.3
13
94
5
51
34
0
0
65
0.93
84713981--84714021
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84717081--84717106
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
84718575--84718604
2
15.5
2
93
6
53
53
0
0
46
1.00
84721757--84721999
133
1.8
133
80
5
294
36
13
12
37
1.82
84724269--84724403
51
2.6
50
77
10
139
60
2
10
27
1.42
84724269--84724405
25
5.4
25
75
11
109
60
2
10
27
1.41
84724454--84724521
30
2.5
25
78
19
73
66
2
4
26
1.25
84724545--84724674
48
2.6
48
77
16
131
57
3
5
33
1.37
84724581--84724610
15
1.9
16
93
6
53
56
0
6
36
1.26
84724509--84724674
26
6.7
26
67
12
98
57
3
6
33
1.41
84724457--84724694
24
9.3
26
68
11
102
58
3
5
31
1.38
84725241--84725292
11
4.9
11
83
9
72
28
28
0
42
1.56
84725235--84725292
20
2.7
21
86
10
82
31
27
0
41
1.56
84725319--84725349
15
2.1
15
93
0
53
22
6
0
70
1.09
84727496--84727877
116
3.3
116
92
2
635
39
3
8
48
1.51
84730892--84731430
126
4.3
126
88
2
787
27
21
17
33
1.95
84731517--84731720
96
2.1
95
82
6
250
41
17
2
38
1.63
84734931--84734970
20
2.0
20
95
0
71
22
20
27
30
1.98
84736253--84736337
18
4.7
18
79
0
89
36
15
12
35
1.86
84736241--84736334
36
2.6
36
86
6
145
37
14
12
35
1.85
84737729--84737761
5
6.6
5
89
10
50
0
21
0
78
0.75
84737729--84737765
14
2.5
15
83
16
51
0
24
0
75
0.80
84743617--84743727
19
5.8
19
72
16
52
62
2
2
32
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84743908--84743946
16
2.4
16
82
0
51
28
20
7
43
1.79
84745257--84745309
27
2.0
27
96
0
97
22
33
35
7
1.83
84745927--84746982
144
7.3
145
85
7
1326
58
7
5
28
1.48
84757632--84757694
30
2.1
30
93
0
108
28
3
11
57
1.49
84758771--84758808
17
2.2
17
95
0
67
15
7
23
52
1.69
84766159--84766208
10
5.0
10
83
9
66
70
2
6
22
1.20
84766222--84766259
13
2.8
13
88
4
58
44
13
0
42
1.43
84777134--84777175
22
1.9
22
95
0
75
61
2
7
28
1.35
84777946--84777995
10
5.0
10
83
9
66
70
2
6
22
1.20
84778174--84778207
18
1.9
17
88
5
50
23
11
5
58
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311