Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  224  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.24
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2.4
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14
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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23
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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19
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0
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70
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76401155--76401211
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2.9
19
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1.54
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3.1
15
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0
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70
0.98
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2.1
19
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1.84
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126
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2
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35
15
16
31
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0
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19
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18
2.6
18
86
3
67
32
4
4
58
1.37
76450740--76450815
27
2.6
30
76
14
70
52
10
1
35
1.44
76451571--76451626
24
2.3
26
81
12
73
57
5
1
35
1.32
76453542--76453658
29
3.9
30
67
10
87
37
8
2
51
1.46
76453559--76453678
60
2.0
60
98
0
231
37
8
5
49
1.55
76458282--76458306
2
12.5
2
100
0
50
52
48
0
0
1.00
76459142--76459187
20
2.2
21
88
3
67
69
6
2
21
1.22
76459149--76459193
20
2.3
19
84
7
54
73
6
0
20
1.05
76461212--76461247
13
2.8
14
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27
25
0
47
1.52
76461199--76461239
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
76461362--76461496
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
76461736--76461774
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
76463094--76463150
5
11.0
5
78
14
62
56
1
0
42
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76463093--76463148
12
4.5
12
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16
69
55
1
0
42
1.10
76463095--76463150
26
2.2
26
90
6
69
55
1
0
42
1.10
76466268--76466319
24
2.2
24
100
0
104
11
25
15
48
1.78
76473032--76473064
16
2.0
17
94
5
59
54
18
12
15
1.71
76474998--76475056
19
3.2
19
75
18
61
61
0
3
35
1.13
76478238--76478264
9
3.0
9
100
0
54
22
11
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0
1.22
76479083--76479161
28
2.9
27
79
5
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26
6
7
59
1.49
76479082--76479282
26
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26
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12
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26
7
7
58
1.52
76479230--76479280
24
2.2
23
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10
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29
9
3
56
1.49
76483293--76483326
12
2.8
12
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0
50
50
17
23
8
1.74
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45
2.7
43
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10
109
34
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22
22
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143
3.0
140
78
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393
32
21
20
26
1.97
76493049--76493166
25
4.7
24
69
14
60
33
7
4
54
1.48
76493225--76493303
28
2.9
27
81
5
88
29
6
3
60
1.39
76493372--76493422
24
2.2
23
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10
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29
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3
52
1.58
76494697--76494752
28
2.0
28
100
0
112
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14
25
1.87
76496028--76496076
21
2.6
18
76
17
53
16
10
40
32
1.82
76496934--76496992
27
2.2
26
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3
73
57
13
8
20
1.62
76497005--76497176
63
2.6
66
84
7
235
47
24
6
21
1.75
76499890--76500046
39
4.0
39
89
0
224
23
27
20
28
1.99
76502317--76502360
10
4.6
9
83
11
52
18
2
2
77
0.98
76502319--76502360
14
2.9
15
82
7
50
16
2
2
78
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76504153--76504204
25
2.1
25
85
0
68
36
9
15
38
1.80
76506689--76506823
63
2.2
61
86
6
191
47
20
8
23
1.78
76507144--76507207
6
10.7
6
100
0
128
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15
0
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1.24
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16
1.9
16
93
0
53
51
16
6
25
1.68
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5
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12
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82
0
0
17
0.66
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12
2.2
12
100
0
52
84
0
0
15
0.62
76507449--76507483
17
2.1
17
100
0
70
82
0
0
17
0.66
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2
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18
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2
0
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1.14
76518934--76518958
13
1.9
13
100
0
50
0
0
16
84
0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311