Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  301  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97993218--97993275
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46
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22
13
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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26
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4.1
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82
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246
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13
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1.92
98058207--98058428
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2.3
97
79
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22
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98062928--98062961
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26
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98085227--98085466
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29
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30
1.9
30
89
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89
41
3
24
31
1.71
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13
2.5
13
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0
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24
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20
1.99
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66
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2.1
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0
5
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.34
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64
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42
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1.43
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120
3.2
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0
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36
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98102460--98102528
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36
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2.2
45
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0
135
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18
17
42
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98142711--98142750
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0
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1.20
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20
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0
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1.34
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3.8
15
84
9
80
56
10
0
33
1.34
98174590--98174622
13
2.5
13
100
0
66
36
15
6
42
1.71
98176767--98176801
12
2.7
13
91
8
54
28
2
0
68
1.04
98178358--98178382
13
1.9
13
100
0
50
16
0
28
56
1.41
98185373--98185470
39
2.5
40
74
22
102
48
1
1
48
1.14
98185382--98185470
7
13.3
7
72
17
55
48
1
1
49
1.16
98186601--98186657
29
1.9
30
92
3
98
21
19
15
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1.87
98186634--98186702
22
3.1
22
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1.88
98187536--98187570
13
2.7
13
100
0
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0
22
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1.53
98194159--98194230
21
3.3
21
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5
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33
27
23
15
1.95
98194421--98194515
28
3.6
24
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13
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33
4
15
1.66
98194435--98194518
28
3.0
28
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1
132
46
30
3
19
1.66
98200609--98200656
13
3.8
12
78
10
60
33
6
27
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98206527--98206577
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2.4
22
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3
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35
1
0
62
1.06
98206528--98206577
10
4.7
11
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7
50
34
2
0
64
1.05
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20
3.3
20
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26
6
3
64
1.32
98207637--98207711
38
2.0
38
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0
141
26
6
2
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1.32
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16
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0
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0
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0
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29
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5
0
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0
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20
0
7
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1.10
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28
0
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0
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5
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31
1
5
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1.31
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2.1
16
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50
41
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5
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1.78
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3
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33
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3
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33
0
33
1.58
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2.0
30
100
0
120
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1.92
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15
2.3
15
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0
0
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2.1
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2
0
60
1.11
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1
2
35
1.21
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29
2.3
29
94
2
118
23
22
0
53
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98298770--98298856
40
2.2
40
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0
165
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20
10
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19
4.6
18
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43
1
1
54
1.15
98305282--98305314
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2.4
14
94
0
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1.75
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2.3
14
100
0
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6
1.71
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47
2.2
47
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145
25
16
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1.94
98319568--98319627
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2.0
30
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0
0
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2
40
1.68
98329636--98329693
20
2.7
21
81
10
64
31
25
1
41
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311