Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  310  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101528175--101528225
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0
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47
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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28
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101626233--101626265
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6
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21
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37
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15
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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(0-2)
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14
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2.0
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1.9
22
85
5
57
39
9
2
48
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101756463--101756503
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2.0
21
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39
0
0
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0
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0
126
49
6
6
38
1.54
101777998--101778035
19
2.0
19
100
0
76
36
5
0
57
1.21
101778515--101778556
17
2.5
17
80
7
50
59
2
0
38
1.10
101783455--101783512
27
2.2
26
96
3
107
53
0
13
32
1.40
101788507--101788565
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
101788536--101788585
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
101789157--101789199
18
2.4
18
84
7
52
37
0
2
60
1.10
101791850--101791904
27
2.0
27
85
0
74
69
3
0
27
1.05
101791885--101791933
25
2.0
25
84
8
64
73
6
2
18
1.14
101791859--101791914
27
2.1
27
82
0
67
73
1
1
23
1.03
101792040--101792085
20
2.2
21
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2
2
32
1.19
101798341--101798368
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
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29
2.1
29
82
11
74
33
0
0
66
0.92
101804192--101804268
28
2.6
31
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19
83
35
1
0
63
1.03
101804468--101804639
88
2.0
88
84
0
227
37
23
18
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101808873--101808941
29
2.4
28
77
13
77
43
5
1
49
1.35
101811080--101811107
14
2.0
14
100
0
56
57
7
14
21
1.61
101811800--101811830
6
5.2
6
96
0
53
32
54
0
12
1.38
101811788--101811830
18
2.4
18
84
0
59
32
51
2
13
1.54
101828354--101828447
40
2.3
41
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7
111
21
12
26
39
1.89
101834385--101834427
20
2.2
20
91
4
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25
4
6
62
1.40
101840454--101840498
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3.9
11
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11
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0
0
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0.94
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2.3
24
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0
1
60
1.07
101842629--101842810
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4.0
46
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1
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23
20
1.90
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5.2
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16
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18
26
1.96
101844058--101844351
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3.9
75
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0
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19
25
1.97
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5.2
39
66
16
137
34
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18
26
1.96
101870172--101870395
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2.3
95
75
5
218
38
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15
25
1.92
101878599--101878685
44
2.0
44
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4
131
55
2
4
37
1.33
101882950--101883022
24
3.2
24
66
18
73
20
24
16
38
1.93
101882909--101883227
46
7.0
46
89
1
453
22
23
14
39
1.91
101896754--101896778
12
2.1
12
100
0
50
40
0
28
32
1.57
101898203--101898266
20
3.2
20
77
2
67
35
3
6
54
1.41
101898697--101898758
33
1.9
33
93
3
108
54
3
19
22
1.58
101899310--101899368
29
2.0
29
100
0
118
23
3
16
55
1.56
101902683--101902726
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2.2
21
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47
2
0
50
1.13
101902700--101902725
12
2.2
12
100
0
52
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101905177--101905210
16
2.1
17
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5
61
64
0
11
23
1.26
101907463--101907515
26
2.0
26
96
0
97
58
11
5
24
1.54
101910031--101910314
137
2.0
140
93
2
484
34
6
21
37
1.79
101921146--101921194
23
2.1
24
96
3
91
40
12
12
34
1.80
101925473--101925507
17
2.0
18
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25
2
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1.61
101928741--101928775
17
2.0
18
88
5
54
20
25
2
51
1.61
101930071--101930125
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12
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0
0
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1.00
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46
0
0
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1.00
101931457--101931504
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2.0
24
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0
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0
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1.32
101931469--101931504
12
3.0
12
83
0
54
38
0
58
2
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311