Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  299  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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3.0
141
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624
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28
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.98
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1.98
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57
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
2.0
33
85
11
89
24
18
7
49
1.74
97560973--97561086
58
2.0
58
84
3
149
51
14
8
25
1.70
97561958--97562019
27
2.4
25
80
17
74
56
3
0
40
1.15
97561965--97562023
27
2.2
27
84
6
75
54
3
0
42
1.17
97567407--97567471
30
2.2
28
86
8
85
27
3
4
64
1.28
97568548--97568581
7
4.9
7
85
0
50
29
0
23
47
1.52
97568551--97568588
14
2.5
15
87
8
51
26
0
23
50
1.50
97568644--97568685
11
3.3
13
80
16
52
23
0
2
73
0.94
97568654--97568688
18
2.0
18
88
5
54
31
0
0
68
0.90
97568828--97568870
20
2.2
19
84
12
52
30
0
2
67
1.03
97570040--97570073
12
2.9
12
91
4
52
76
0
23
0
0.79
97570650--97570742
39
2.3
40
83
5
125
39
3
6
50
1.44
97571809--97571847
17
2.3
17
86
0
51
61
2
2
33
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97571789--97571865
38
2.1
37
85
7
102
64
1
1
32
1.09
97571888--97571914
10
2.7
10
100
0
54
59
7
11
22
1.56
97572234--97572292
8
6.7
9
76
16
61
33
0
1
64
1.04
97572245--97572277
17
2.0
16
94
5
57
33
0
0
66
0.92
97572241--97572300
27
2.2
27
85
5
77
35
0
1
63
1.05
97581901--97581942
21
2.0
20
82
13
50
30
7
2
59
1.37
97583521--97583569
20
2.5
20
86
6
64
57
6
0
36
1.24
97583521--97583580
21
2.8
21
80
10
68
56
8
0
35
1.29
97597242--97597274
15
2.1
16
88
5
50
75
0
0
24
0.80
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13
2.1
14
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6
51
41
10
0
48
1.37
97602567--97602608
20
2.1
20
82
8
50
38
2
19
40
1.64
97610762--97610872
47
2.4
47
83
6
145
26
16
22
35
1.95
97612679--97612720
21
2.0
21
81
9
50
21
28
0
50
1.49
97613788--97613818
8
3.9
8
100
0
62
38
0
0
61
0.96
97613747--97613839
49
1.9
48
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10
118
45
1
3
50
1.25
97614033--97614077
22
2.0
24
91
8
76
64
2
33
0
1.06
97613998--97614077
22
3.3
25
78
20
73
67
3
27
1
1.15
97614469--97614584
40
2.9
40
85
3
144
40
10
14
34
1.80
97617258--97617413
42
3.7
42
77
16
169
30
26
18
24
1.98
97628935--97629005
35
2.0
35
100
0
142
40
11
25
22
1.87
97629042--97629100
29
2.0
29
100
0
118
33
23
13
28
1.93
97630647--97630723
14
5.0
15
71
20
52
44
14
7
33
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97630651--97630717
34
1.9
35
87
3
100
47
13
7
31
1.70
97632414--97632456
12
3.7
12
78
6
52
67
2
4
25
1.22
97632684--97632726
16
2.6
17
82
10
54
65
0
4
30
1.13
97632565--97632950
3
126.7
3
72
13
206
62
2
5
29
1.32
97637161--97637190
14
2.1
14
93
0
51
33
10
0
56
1.32
97647139--97647221
21
3.9
21
79
3
67
36
26
21
15
1.94
97647137--97647211
21
3.5
22
83
7
91
38
26
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97647643--97647672
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53
0
23
0
76
0.78
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3
42.0
3
72
15
66
65
2
3
28
1.23
97648825--97648903
29
2.5
31
78
16
90
65
0
5
29
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311