Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  281  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91951741--91951819
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91960767--91960812
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10
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2.2
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26
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2.0
27
82
6
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30
8
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57
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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2.0
65
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28
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1.95
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1.9
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15
2.1
14
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5
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91990692--91990724
14
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0
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92008226--92008454
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92
2
370
38
14
24
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92010105--92010221
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44
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35
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26
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2.0
27
82
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67
30
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18
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
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2.1
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189
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17
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16
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1.40
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1.46
92076793--92076878
31
2.6
32
90
9
129
59
2
13
24
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92078701--92078733
16
2.1
16
100
0
66
33
30
0
36
1.58
92080333--92080358
12
2.2
12
100
0
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69
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7
15
1.35
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0
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44
1.20
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25
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2.6
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1.29
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100
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0
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1
0
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19
21
21
37
1.95
92119823--92119884
27
2.3
27
80
0
70
37
1
9
51
1.45
92124768--92124814
20
2.3
20
78
7
51
29
2
6
61
1.32
92124725--92124822
50
1.9
51
87
2
144
30
6
6
57
1.48
92138224--92138347
33
3.8
33
96
0
230
17
9
42
29
1.81
92140581--92140631
18
2.9
18
77
14
61
27
33
0
39
1.57
92156014--92156084
9
7.3
9
74
14
61
29
0
0
70
0.88
92155986--92156090
42
2.6
39
82
13
131
37
0
0
60
1.09
92156219--92156247
13
2.1
14
93
6
51
79
0
3
17
0.87
92243112--92243187
28
2.7
29
76
14
68
55
3
2
38
1.33
92243200--92243259
19
3.3
19
84
9
72
48
5
1
45
1.34
92243464--92243522
24
2.5
22
76
12
55
42
0
1
55
1.09
92244056--92244126
24
3.1
21
75
16
70
43
0
1
54
1.08
92244059--92244110
13
4.2
12
76
11
52
46
0
1
51
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92244064--92244126
24
2.8
22
83
7
81
44
0
1
53
1.10
92244054--92244133
22
3.5
22
80
8
88
43
0
1
55
1.08
92244123--92244180
22
2.8
20
80
12
64
34
1
0
63
1.04
92244137--92244259
31
3.8
33
75
16
96
36
0
2
60
1.16
92244077--92244273
67
2.9
65
73
17
179
39
1
1
58
1.14
92244236--92244268
14
2.3
15
94
5
59
42
0
0
57
0.98
92244791--92245261
208
2.3
208
97
0
879
44
6
10
38
1.65
92245772--92245847
31
2.7
28
78
11
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57
5
2
34
1.35
92245832--92245864
17
1.9
17
88
11
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54
0
3
42
1.15
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22
1.9
23
90
9
70
57
0
2
40
1.12
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24
2.5
23
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8
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52
0
1
45
1.10
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23
3.1
21
75
16
61
53
1
1
43
1.18
92246682--92246723
18
2.5
17
85
11
59
42
2
0
54
1.13
92262096--92262151
25
2.2
25
83
0
67
44
0
3
51
1.18
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12
3.2
12
81
0
51
58
0
38
2
1.12
92269980--92270014
15
2.4
15
90
4
54
25
0
8
65
1.21
92270054--92270115
28
2.2
28
82
5
72
50
0
1
48
1.10
92270307--92270349
20
2.2
20
83
8
52
55
0
2
41
1.12
92290880--92290934
25
2.2
25
83
6
67
27
3
0
69
1.05
92290881--92290941
25
2.4
24
76
13
59
24
3
0
72
1.00
92291071--92291120
22
2.2
23
89
3
75
36
4
4
56
1.37
92292983--92293021
17
2.3
18
83
16
57
20
12
0
66
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92292986--92293024
16
2.4
16
88
12
62
23
12
0
64
1.28
92296657--92296696
11
3.6
11
86
0
53
42
2
5
50
1.37
92299300--92299347
20
2.5
20
83
10
55
33
10
10
45
1.72
92301272--92301321
21
2.4
21
79
0
55
34
20
6
40
1.77
92301287--92301326
21
1.9
21
84
0
53
35
12
7
45
1.70
92303609--92303655
6
7.8
6
97
0
76
17
55
10
17
1.69
92307065--92307758
346
2.0
347
98
0
1345
46
19
8
25
1.78
92310798--92311370
176
3.3
175
86
3
753
27
24
18
30
1.98
92311399--92311788
172
2.2
173
81
7
443
27
24
17
30
1.97
92311657--92312040
147
2.6
147
95
0
689
24
26
17
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311