Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  26  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
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0
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Period
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Copy
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22
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7531371--7531435
22
3.0
22
88
6
89
30
4
20
44
1.71
7536372--7536475
40
2.6
40
85
0
127
36
22
13
27
1.92
7536462--7536488
12
2.2
12
100
0
54
33
7
18
40
1.78
7537279--7537312
5
6.8
5
87
12
52
0
17
0
82
0.67
7537348--7537378
3
10.3
3
100
0
62
35
32
0
32
1.58
7537698--7537982
145
2.0
142
86
4
403
45
4
8
42
1.54
7541136--7541225
47
1.9
47
97
0
171
32
12
17
37
1.87
7542507--7542687
48
3.8
48
85
2
220
19
17
26
36
1.94
7542511--7542687
96
1.8
96
85
0
246
19
17
27
36
1.94
7557892--7558057
35
4.6
37
79
10
164
31
9
25
33
1.88
7557892--7558062
75
2.4
75
82
7
194
32
9
24
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7558176--7558287
56
2.0
56
100
0
224
32
7
23
37
1.82
7568643--7568681
18
2.2
18
95
0
69
23
7
5
64
1.40
7583919--7583958
19
2.1
19
100
0
80
35
15
0
50
1.44
7585700--7585735
19
1.9
19
88
5
56
58
22
8
11
1.59
7588937--7588978
14
3.1
14
80
12
52
33
2
11
52
1.51
7593564--7593612
25
2.0
25
84
4
64
63
8
0
28
1.23
7593576--7593640
25
2.9
23
80
15
66
66
7
0
26
1.19
7593602--7593640
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
7595433--7595472
20
2.0
20
90
0
62
47
17
12
22
1.81
7596916--7596974
24
2.4
25
82
2
66
15
23
23
37
1.93
7598995--7599078
43
2.0
43
90
0
132
25
17
28
28
1.98
7606795--7606878
43
2.0
43
83
4
107
23
15
33
27
1.95
7612693--7612738
12
3.5
13
80
14
51
47
39
2
10
1.51
7613235--7613313
3
26.3
3
72
23
53
30
3
1
64
1.19
7613239--7613313
18
4.1
18
80
14
82
30
4
1
64
1.20
7613225--7613317
25
3.7
24
73
13
71
29
3
1
66
1.14
7614663--7614690
13
2.2
13
100
0
56
32
32
7
28
1.84
7614771--7614795
13
1.9
13
100
0
50
40
16
28
16
1.89
7615031--7615096
28
2.4
28
94
0
114
25
9
27
37
1.86
7615031--7615096
14
4.7
14
80
0
78
25
9
27
37
1.86
7634062--7634104
20
2.2
20
87
8
61
48
0
4
46
1.22
7635075--7635154
26
3.0
26
75
12
83
33
1
6
58
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7635045--7635154
53
2.1
53
86
6
152
33
3
5
57
1.39
7651867--7651907
21
2.0
21
81
18
50
31
19
26
21
1.97
7654501--7654540
20
2.0
20
100
0
80
25
10
10
55
1.64
7659346--7659407
26
2.4
27
78
8
65
3
6
20
69
1.25
7662365--7662585
46
4.8
45
87
3
280
42
14
23
19
1.87
7663424--7663481
30
1.9
31
83
13
77
46
1
0
51
1.11
7663487--7663561
38
2.0
38
84
5
98
64
1
1
33
1.11
7663498--7663564
9
7.2
9
80
6
71
65
0
1
32
1.02
7670785--7670891
53
2.0
53
98
0
205
22
8
16
52
1.71
7683715--7683777
28
2.3
26
84
7
81
25
14
4
55
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311