Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  30  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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0
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18
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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230
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8
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0
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2
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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2.0
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118
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137
47
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0
28
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8741065--8741106
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2.5
17
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50
45
4
9
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1.58
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2.7
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88
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1.95
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2
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2.0
21
85
9
57
32
0
5
62
1.17
8780556--8780596
20
2.2
20
82
8
50
31
2
4
60
1.30
8780643--8780710
31
2.3
31
87
5
95
63
1
2
32
1.18
8782180--8782267
41
2.1
41
89
0
131
28
13
21
36
1.92
8782192--8782292
41
2.4
41
88
4
141
26
13
22
36
1.92
8784179--8784227
19
2.3
23
80
13
61
48
0
12
38
1.41
8789105--8789133
14
2.1
14
93
6
51
48
13
6
31
1.69
8801515--8801568
28
1.9
28
88
0
81
50
3
0
46
1.19
8803742--8803796
25
2.3
23
84
6
65
32
3
1
61
1.24
8811779--8811859
32
2.6
31
80
2
90
29
3
16
50
1.62
8813203--8813232
14
2.2
14
94
5
53
40
13
6
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8813526--8813836
153
2.0
153
94
0
550
23
16
10
48
1.77
8821433--8821473
20
2.1
20
86
4
57
51
2
4
41
1.36
8825373--8825416
15
2.9
15
93
0
70
18
18
18
45
1.86
8825488--8825546
29
2.0
29
100
0
118
27
13
3
55
1.54
8837963--8838079
23
5.0
23
73
12
112
29
25
29
14
1.95
8840228--8840276
3
17.3
3
76
19
52
69
0
2
28
1.00
8840234--8840272
11
3.5
11
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0
69
69
0
2
28
1.02
8840235--8840276
19
2.2
19
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8
59
71
0
2
26
0.98
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20
2.7
20
85
8
65
56
5
0
37
1.23
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15
2.0
15
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0
51
23
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26
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1.96
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14
3.0
14
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12
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46
9
0
44
1.35
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21
2.2
21
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2
19
2
1.00
8845220--8845246
12
2.2
12
100
0
54
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7
33
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1.58
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48
2.8
48
86
7
164
30
21
16
31
1.95
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49
2.5
49
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133
29
21
15
33
1.94
8862146--8862170
4
6.2
4
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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19
2.3
19
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0
50
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0
0
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1.00
8867933--8867991
30
2.0
30
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0
100
30
25
5
38
1.77
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18
2.4
18
88
0
59
20
25
9
44
1.81
8873221--8873741
126
4.1
125
88
2
715
28
16
17
37
1.92
8873221--8873741
251
2.1
253
87
4
750
28
16
17
37
1.92
8873802--8873877
34
2.2
34
90
0
116
50
6
0
43
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8873813--8873936
34
3.7
34
81
6
128
40
16
0
42
1.53
8874394--8874486
50
1.9
50
86
4
127
36
3
7
52
1.46
8902287--8902334
16
3.0
16
84
6
62
77
0
0
22
0.78
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27
2.9
27
90
0
129
19
28
38
14
1.90
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11
2.7
11
100
0
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50
13
0
36
1.42
8904268--8904324
27
2.1
27
100
0
114
15
38
28
17
1.91
8906548--8906624
5
15.0
5
79
12
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0
3
15
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0
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0
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13
0.82
8906549--8906625
6
12.7
6
84
11
79
81
0
3
14
0.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311