Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  298  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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88
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22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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22
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37
0
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59
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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54
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8
13
46
1.74
97229383--97229443
29
2.1
30
90
9
99
26
4
11
57
1.54
97235426--97235502
32
2.4
32
80
0
91
44
6
24
24
1.77
97239932--97240008
32
2.4
32
80
0
91
44
6
24
24
1.77
97240311--97240357
15
3.1
15
87
0
67
17
68
6
8
1.37
97240308--97240371
21
3.0
21
83
0
83
15
68
6
9
1.36
97240311--97240363
15
3.5
15
86
0
61
15
67
7
9
1.39
97240401--97240440
15
2.6
16
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11
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20
5
47
27
1.70
97250916--97251025
54
2.0
54
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202
20
22
15
40
1.90
97252632--97252788
46
3.4
47
89
3
230
19
22
14
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1.86
97253562--97253589
10
2.8
10
100
0
56
32
17
0
50
1.47
97254945--97255013
11
6.1
11
79
12
68
65
1
0
33
1.02
97258079--97258335
91
2.8
91
83
1
318
19
23
14
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97258074--97258345
46
6.0
46
82
2
289
19
23
14
42
1.88
97260483--97260513
11
2.8
11
100
0
62
74
0
0
25
0.82
97260483--97260551
11
6.1
11
77
12
59
63
2
0
33
1.09
97262295--97262324
15
2.0
15
100
0
60
53
13
6
26
1.64
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53
3.1
53
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6
221
25
15
28
30
1.96
97278138--97278303
53
3.1
53
88
6
221
25
15
28
30
1.96
97280845--97281009
51
3.0
57
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12
216
32
14
24
28
1.94
97280891--97281012
51
2.4
51
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0
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13
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29
1.93
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2.0
58
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0
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1.95
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25
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74
16
26
22
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1.95
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46
4.8
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26
20
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22
1.98
97302547--97302758
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2.3
90
82
4
237
26
20
31
22
1.98
97312682--97312713
16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
46
1.49
97312923--97313190
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5.3
50
80
2
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25
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26
1.97
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1.9
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3
91
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10
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1.75
97316656--97316695
14
2.9
14
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0
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15
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35
1.75
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101
1.8
101
88
0
274
30
24
18
26
1.98
97316713--97317079
151
2.4
151
93
0
626
30
24
17
27
1.97
97316713--97317085
50
7.4
50
74
3
318
30
24
17
27
1.97
97319832--97319880
22
2.2
22
78
7
55
59
8
12
20
1.58
97342415--97342448
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1.9
18
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52
11
5
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1.24
97347353--97347446
23
4.1
23
85
0
134
22
25
4
47
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97350209--97350302
23
4.1
23
87
0
143
22
24
4
48
1.68
97351746--97351786
19
2.1
20
86
4
57
70
4
2
21
1.18
97352271--97352337
21
3.1
21
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64
2
4
28
1.28
97352304--97352341
19
1.9
21
89
10
62
63
0
5
31
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97352626--97352677
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20
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1
0
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0
0
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1
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97373765--97373805
21
1.9
21
85
5
55
58
2
24
14
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311