Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  7  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1853125--1853209
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12
81
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2
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1.40
1853345--1853413
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2.0
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1853510--1853544
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0
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21
20
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1862594--1862693
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0
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0
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9
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1883633--1883667
18
2.0
17
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11
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2.0
20
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0
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1.00
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1
0
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1883996--1884076
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2.8
29
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1.08
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2.8
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1
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29
1.21
1884422--1884450
14
2.1
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0
13
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2.0
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2.0
32
100
0
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15
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1899777--1899942
40
4.2
40
85
3
183
22
28
15
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1899789--1899858
20
3.5
20
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7
52
20
34
14
31
1.92
1928158--1928213
22
2.5
22
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16
53
21
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1.36
1928365--1928410
16
2.8
16
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56
32
0
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58
1.28
1940208--1940267
28
2.2
28
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113
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1947748--1947790
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20
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2
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1957036--1957070
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36
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27
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66
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1972896--1972943
21
2.3
20
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29
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10
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1973161--1973203
17
2.5
17
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1976654--1976723
24
2.9
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34
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1.9
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20
1.9
20
88
0
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100
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2.1
57
96
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43
10
18
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1986773--1986812
18
2.3
18
87
8
57
67
0
7
25
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1991491--1991520
14
2.1
14
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0
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13
0
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1.9
13
100
0
50
24
24
4
48
1.68
1997827--1997872
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12
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18
20
30
29
1.97
2016459--2016650
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2.1
90
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17
20
30
1.95
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2.8
12
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17
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21
24
14
39
1.91
2063779--2063945
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1.8
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21
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14
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1.91
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184
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16
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1.91
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0
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1.67
2082792--2082842
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15
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29
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21
1.62
2082970--2083041
37
1.9
37
83
5
92
22
0
31
45
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2083080--2083180
41
2.4
41
83
1
130
20
27
19
31
1.97
2083183--2083316
41
3.3
41
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4
211
21
20
20
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1.94
2083509--2083620
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2.0
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17
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2084436--2084481
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8
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24
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27
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0
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21
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1.92
2123772--2123862
46
2.0
46
88
0
137
46
23
10
19
1.82
2123787--2123864
23
3.4
23
78
0
93
47
24
11
16
1.80
2126582--2126627
19
2.4
19
80
20
60
36
13
0
50
1.41
2128454--2128482
14
2.0
15
93
6
51
58
0
6
34
1.25
2128342--2128684
173
2.0
169
90
4
537
41
6
18
33
1.76
2132473--2132511
20
2.0
20
84
0
51
30
30
12
25
1.93
2135140--2135193
26
2.0
26
82
3
63
42
5
3
48
1.44
2136167--2136292
63
2.0
63
98
0
243
34
11
11
42
1.77
2139685--2139719
14
2.5
14
90
0
52
51
5
0
42
1.25
2143026--2143070
17
2.6
17
86
10
65
17
17
33
31
1.94
2160943--2160994
22
2.4
22
96
0
95
36
26
15
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2166406--2166508
33
3.2
33
67
22
92
21
10
17
50
1.76
2167210--2167261
27
1.9
27
88
0
77
19
13
25
42
1.87
2168271--2168320
24
2.0
24
88
3
73
4
22
2
72
1.12
2169053--2169111
27
2.3
26
75
19
61
45
1
0
52
1.10
2170348--2170384
17
2.1
19
90
10
60
32
10
2
54
1.49
2172005--2172031
13
2.1
13
100
0
54
37
7
0
55
1.28
2172965--2173007
20
2.1
21
87
12
63
79
2
0
18
0.85
2172961--2173008
20
2.5
19
78
15
55
75
2
0
22
0.91
2177612--2177655
16
2.9
15
80
10
54
36
0
11
52
1.38
2181335--2181364
15
2.0
15
93
0
51
3
26
0
70
1.03
2181382--2181423
12
3.2
13
83
10
50
16
7
0
76
1.00
2181411--2181441
16
1.9
16
100
0
62
22
6
0
70
1.09
2181446--2181492
16
3.1
15
76
11
51
46
0
0
53
1.00
2191833--2191891
16
3.7
16
81
0
73
44
1
25
28
1.64
2191846--2191900
16
3.4
16
79
0
56
40
5
25
29
1.78
2196050--2196095
24
1.9
24
90
0
74
10
17
39
32
1.84
2199534--2199610
37
2.1
37
97
0
145
46
7
5
40
1.55
2200067--2200111
19
2.4
19
86
13
67
66
13
2
17
1.34
2204245--2204278
13
2.6
13
100
0
68
32
32
20
14
1.93
2204486--2204532
10
4.6
10
80
12
51
55
27
0
17
1.42
2205250--2205345
41
2.3
40
84
10
113
32
29
12
26
1.93
2205228--2205386
40
3.9
40
76
11
126
32
26
13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2205656--2205696
21
1.9
22
85
5
57
26
29
4
39
1.77
2205686--2205896
107
2.0
107
98
0
406
35
26
6
31
1.82
2206636--2206671
15
2.4
15
90
0
54
55
2
13
27
1.52
2207889--2207932
23
1.9
23
95
0
79
56
2
2
38
1.24
2208928--2209252
127
2.6
128
77
6
313
37
18
16
27
1.92
2209700--2209742
18
2.4
18
84
3
52
67
2
6
23
1.27
2210030--2210097
3
23.0
3
74
14
52
64
5
2
26
1.30
2212009--2212090
26
3.2
26
98
0
155
30
7
25
36
1.83
2216844--2216890
17
2.8
17
84
15
62
65
0
8
25
1.20
2216963--2217312
3
115.3
3
69
7
161
61
2
8
27
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311