Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  297  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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145
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
96919221--96919354
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300
33
12
22
31
1.91
96935897--96936065
58
3.0
58
85
8
253
34
11
21
32
1.89
96935853--96936065
109
2.0
105
92
6
360
33
12
22
32
1.91
96935996--96936021
7
3.7
7
100
0
52
42
0
30
26
1.56
96939836--96939881
20
2.2
21
84
3
58
8
19
4
67
1.35
96939837--96939873
13
2.8
14
84
8
51
8
21
2
67
1.29
96943909--96944352
221
2.0
221
97
0
843
36
14
17
30
1.91
96944860--96944970
25
4.4
25
74
12
84
58
5
9
27
1.50
96944860--96945016
75
2.1
75
80
9
169
58
5
8
27
1.50
96944980--96945041
28
2.2
28
82
5
72
59
3
11
25
1.46
96946741--96946807
30
2.2
31
86
7
93
52
4
4
38
1.42
96948812--96948856
23
2.0
23
86
8
65
4
4
20
71
1.21
96968263--96968313
15
3.5
15
70
5
50
31
0
7
60
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96969922--96970020
49
2.0
49
96
0
180
14
14
43
28
1.84
96977939--96977963
11
2.3
11
100
0
50
56
0
8
36
1.29
96978716--96978754
18
2.1
18
85
9
51
38
0
5
56
1.22
96984957--96984997
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
96989626--96989668
18
2.4
18
84
3
52
74
2
6
16
1.14
96994075--96994115
2
20.5
2
84
0
55
0
41
2
56
1.13
96994075--96994115
12
3.2
12
87
12
64
0
41
2
56
1.13
96998215--96998247
15
2.2
15
100
0
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30
18
0
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1.46
97002497--97002540
18
2.4
18
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0
61
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13
15
38
1.87
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2.3
53
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2
172
42
22
16
18
1.88
97010407--97010458
18
2.6
21
82
17
58
55
0
0
44
0.99
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30
3.0
30
91
0
146
27
48
3
20
1.65
97012873--97013006
60
2.2
59
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6
153
26
47
4
22
1.70
97013504--97013635
25
5.5
23
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20
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35
4
2
57
1.32
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4.5
27
70
9
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33
6
4
55
1.45
97013518--97013723
25
8.2
25
69
14
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34
5
3
55
1.42
97013877--97013924
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
97013877--97013928
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
97018834--97019056
84
2.7
83
78
6
229
50
6
13
29
1.68
97021288--97021333
21
2.3
20
82
10
51
56
4
0
39
1.19
97024625--97024662
3
12.7
3
94
0
67
28
2
0
68
1.03
97032176--97032222
17
2.8
17
80
6
51
27
0
12
59
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97035426--97035480
22
2.5
22
84
3
65
69
7
20
3
1.28
97037006--97037067
21
2.8
23
75
7
74
16
19
22
41
1.89
97042963--97043018
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
97042952--97043018
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
97043068--97043164
25
4.0
24
90
5
142
31
21
20
25
1.98
97043067--97043164
49
2.0
49
90
7
155
31
22
20
25
1.98
97044169--97044532
182
2.0
182
96
0
665
35
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14
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1.92
97044703--97044746
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2.0
22
100
0
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1.92
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2.8
21
89
0
80
15
24
17
43
1.87
97050898--97051059
83
2.0
83
94
0
288
39
20
19
20
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311