Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  264  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
C
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(0-2)
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25
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1.85
87740800--87740990
72
2.6
72
80
8
226
38
15
12
34
1.85
87741169--87741407
45
5.3
45
90
1
354
41
22
18
17
1.90
87741169--87741407
89
2.7
89
88
3
354
41
22
18
17
1.90
87741815--87741856
5
8.2
5
84
5
57
40
19
0
40
1.51
87743151--87743184
17
2.1
16
94
5
59
0
35
0
64
0.94
87743162--87743195
13
2.5
13
90
4
50
0
38
2
58
1.13
87743228--87743274
9
5.3
9
79
5
51
21
10
0
68
1.20
87743228--87743262
17
2.0
17
88
5
52
20
11
0
68
1.20
87743246--87743270
13
1.9
13
100
0
50
24
12
0
64
1.27
87746188--87746257
30
2.3
32
80
9
83
47
4
15
32
1.65
87746493--87746517
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
87747751--87747909
43
3.7
43
79
13
175
31
27
18
23
1.97
87747753--87747909
44
3.7
43
78
16
173
31
26
18
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87752864--87752914
15
3.6
15
74
15
63
9
11
45
33
1.74
87752864--87752944
27
3.1
27
89
5
114
11
11
41
35
1.76
87752840--87752992
24
6.2
24
81
6
128
9
15
39
35
1.79
87755050--87755115
20
3.0
20
70
18
60
51
0
10
37
1.37
87755360--87755393
17
1.9
18
88
5
52
50
2
0
47
1.16
87760608--87760645
18
2.0
19
85
10
51
55
0
0
44
0.99
87760630--87760695
31
2.2
31
86
10
93
54
0
1
43
1.09
87762480--87762571
47
1.9
48
91
2
150
31
6
29
32
1.83
87764301--87764608
89
3.5
85
75
10
262
25
5
12
55
1.59
87767133--87767175
12
3.8
12
78
12
54
32
18
0
48
1.48
87767199--87767258
21
3.0
19
83
11
75
21
10
0
68
1.19
87767199--87767253
20
2.7
20
88
2
74
23
10
0
65
1.24
87767229--87767267
16
2.5
15
84
12
51
25
10
0
64
1.25
87767279--87767324
18
2.5
19
92
3
76
19
10
4
65
1.41
87767279--87767351
23
3.4
21
73
23
62
21
10
2
64
1.38
87767337--87767381
5
8.4
5
86
13
63
24
17
0
57
1.40
87767338--87767380
23
2.0
21
90
9
68
25
18
0
55
1.42
87767337--87767400
16
3.9
17
82
13
64
29
14
0
56
1.39
87767359--87767408
15
3.1
16
80
13
59
30
10
0
60
1.30
87767385--87767440
19
2.8
20
78
21
64
26
7
1
64
1.29
87767577--87767630
25
2.1
26
86
3
74
38
5
0
55
1.23
87767786--87767823
19
2.0
19
94
0
67
18
21
0
60
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87767808--87767847
12
3.3
13
76
20
50
15
15
0
70
1.18
87767808--87767857
23
2.2
23
88
0
73
18
14
0
68
1.22
87767814--87767863
23
2.2
23
85
0
64
22
14
0
64
1.29
87767845--87767963
22
5.6
22
68
21
65
27
7
0
64
1.20
87767871--87767955
44
1.9
44
85
0
116
28
8
0
63
1.23
87767899--87767957
27
2.2
26
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9
73
27
6
0
66
1.17
87767844--87767889
17
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32
4
0
63
1.14
87767986--87768089
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21
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0
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18
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61
32
13
0
53
1.41
87768559--87768649
44
2.1
44
95
2
166
37
0
9
52
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311