Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  302  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Score
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98440923--98441266
73
4.7
72
86
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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18
10
25
1.81
98561908--98562040
64
2.1
64
100
0
266
27
21
17
33
1.96
98564771--98564796
13
2.0
13
100
0
52
76
0
7
15
0.99
98573230--98573275
20
2.3
21
85
7
60
54
2
13
30
1.50
98573288--98573664
151
2.5
151
99
0
747
25
21
23
29
1.99
98584305--98584346
22
1.9
22
100
0
84
16
14
23
45
1.84
98589511--98589543
15
2.2
15
89
10
50
42
45
6
6
1.53
98590677--98590770
3
31.3
3
76
8
84
29
7
2
60
1.36
98593287--98593338
20
2.7
18
77
11
50
53
3
0
42
1.19
98593391--98593416
9
2.9
9
100
0
52
46
0
0
53
1.00
98593367--98593406
20
2.0
21
85
5
55
62
2
0
35
1.09
98595792--98595888
33
2.8
35
72
20
89
45
2
1
51
1.19
98596072--98596137
13
5.1
13
77
0
69
36
19
7
36
1.81
98596623--98596648
7
3.7
7
100
0
52
61
0
26
11
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98598569--98598621
24
2.2
24
96
0
97
13
49
3
33
1.60
98601618--98601718
50
2.0
50
100
0
202
44
5
17
31
1.73
98601982--98602021
20
2.0
20
90
0
62
50
12
10
27
1.72
98606249--98606394
60
2.4
59
78
8
154
31
15
8
44
1.76
98616295--98616342
24
2.2
23
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14
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2
10
45
1.50
98625030--98625096
28
2.4
28
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11
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32
1
1
64
1.12
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30
2.0
30
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0
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0
13
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1.35
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21
2.7
22
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35
1
3
60
1.23
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2.2
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2
118
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8
0
24
1.18
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3.2
18
70
15
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67
0
0
32
0.91
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27
2.8
27
81
9
86
66
0
2
30
1.05
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29
2.0
29
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15
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25
10
6
58
1.55
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21
2.0
21
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9
57
51
2
0
46
1.14
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7
6.1
7
100
0
86
44
0
0
55
0.99
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10
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0
0
50
1.00
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114
2.1
116
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455
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6
47
1.63
98642796--98642853
30
1.9
31
85
3
82
50
5
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37
1.52
98643271--98643312
10
4.2
10
85
11
59
76
7
7
9
1.17
98663648--98663688
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
98667512--98667540
14
2.0
15
93
6
51
13
20
0
65
1.26
98668010--98668051
20
2.1
20
86
0
57
64
7
7
21
1.43
98698059--98698104
22
2.1
22
100
0
92
45
21
4
28
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98701050--98701110
5
12.0
5
96
3
113
60
0
0
39
0.97
98703898--98703946
20
2.6
18
83
6
53
24
6
0
69
1.11
98703917--98703958
18
2.3
18
80
8
50
28
4
2
64
1.26
98705943--98705981
2
19.5
2
100
0
78
0
48
0
51
1.00
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21
2.0
21
95
0
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24
17
29
29
1.97
98717003--98717043
21
2.0
21
90
0
64
26
29
19
24
1.98
98717074--98717137
31
2.1
31
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21
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4.0
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30
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1.97
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2.2
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2
102
45
19
7
27
1.76
98736943--98737000
28
2.1
28
100
0
116
43
17
6
32
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          305   306   307   308   309   310   311