Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  51  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14621102--14621333
50
4.7
49
75
11
154
55
4
6
33
1.45
14621288--14621339
24
2.2
23
83
10
61
59
0
3
36
1.16
14621827--14621880
18
3.3
18
66
28
57
22
7
48
22
1.75
14621827--14621910
18
5.4
17
64
30
53
20
7
47
25
1.75
14621822--14621917
30
3.2
30
92
0
165
17
6
48
27
1.71
14622617--14622655
20
2.0
20
85
14
55
58
7
28
5
1.47
14625806--14626096
100
2.9
100
79
2
305
34
16
22
26
1.95
14628471--14628583
47
2.4
47
98
0
217
30
30
16
21
1.95
14629014--14629071
30
1.9
30
82
6
73
29
27
5
37
1.78
14642420--14642516
7
13.9
7
96
0
167
45
14
13
26
1.82
14644890--14644943
22
2.5
22
90
3
92
35
18
7
38
1.79
14644901--14644992
17
4.9
19
83
16
122
34
16
10
38
1.84
14645107--14645145
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
14645338--14645668
45
7.4
45
87
1
441
25
29
13
30
1.94
14645338--14645655
89
3.6
89
90
0
465
26
30
13
29
1.94
14645338--14645668
134
2.5
134
87
1
475
25
29
13
30
1.94
14645685--14646213
78
6.8
78
91
0
803
24
23
18
33
1.97
14646415--14646690
131
2.2
127
84
6
348
27
21
16
35
1.94
14646077--14646616
298
1.8
298
91
0
893
26
22
17
33
1.96
14646468--14646712
131
1.9
131
92
1
411
25
21
16
36
1.94
14656605--14657158
47
11.7
47
93
2
925
29
29
8
32
1.87
14656605--14657158
143
3.9
141
94
2
925
29
29
8
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14660977--14661182
40
5.2
40
87
0
241
26
27
20
25
1.99
14662632--14663137
47
10.7
47
92
3
811
29
29
8
33
1.87
14662632--14663137
96
5.3
94
93
3
811
29
29
8
33
1.87
14662632--14663120
238
2.1
239
94
1
860
29
28
8
33
1.87
14668776--14668851
22
3.7
21
78
11
59
42
17
6
34
1.75
14668805--14668902
35
2.7
37
87
12
150
35
16
10
37
1.82
14668812--14668902
19
4.9
19
92
8
161
36
15
10
37
1.83
14669017--14669055
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
14683040--14683258
48
4.6
48
92
0
339
26
18
28
26
1.98
14682985--14683258
96
2.9
95
85
4
337
26
18
27
27
1.99
14688143--14688177
4
8.5
4
87
6
52
25
2
0
71
1.00
14695151--14695264
58
2.0
58
98
0
219
41
35
7
15
1.77
14701790--14701836
24
2.0
24
91
0
76
40
25
8
25
1.84
14703746--14703992
49
5.0
50
81
2
282
25
19
27
28
1.99
14707107--14707353
49
5.0
50
81
2
291
25
19
27
28
1.98
14711839--14711878
21
2.0
21
95
5
73
20
30
40
10
1.85
14713003--14713221
47
4.7
46
73
8
151
26
30
16
26
1.97
14713003--14713221
96
2.3
92
80
5
217
26
30
16
26
1.97
14715761--14716128
192
1.9
192
82
6
469
33
13
18
33
1.90
14724403--14724586
79
2.3
81
83
8
227
25
27
22
24
2.00
14724384--14724586
39
5.1
40
81
9
229
24
27
22
25
2.00
14732245--14732429
40
4.7
40
79
7
191
24
26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14734599--14734632
14
2.5
13
86
13
50
0
32
0
67
0.91
14734599--14734662
15
4.4
15
79
13
71
1
31
0
67
1.00
14734613--14734651
19
2.0
20
90
5
62
0
28
0
71
0.86
14734849--14734888
3
13.3
3
83
0
53
32
0
7
60
1.25
14734851--14734894
15
2.9
15
86
0
52
34
0
9
56
1.31
14742526--14742569
16
2.8
15
89
6
61
0
27
0
72
0.85
14744798--14744838
21
2.0
21
90
0
64
26
17
29
26
1.97
14748195--14748246
22
2.4
22
84
9
63
69
7
11
11
1.37
14748957--14749013
4
14.2
4
100
0
114
24
0
26
49
1.51
14752895--14752943
22
2.2
23
85
10
66
77
6
10
6
1.11
14753373--14753429
10
5.7
10
74
14
55
38
0
7
54
1.28
14753373--14753430
20
2.8
20
80
12
66
39
0
6
53
1.28
14753876--14753921
20
2.2
21
92
3
76
50
19
6
23
1.71
14768202--14768250
20
2.8
17
87
12
64
57
2
2
38
1.22
14768202--14768258
16
3.3
17
77
17
55
56
1
1
40
1.20
14768517--14768581
16
3.9
17
75
15
55
53
4
1
40
1.31
14772931--14773044
45
2.5
45
81
6
142
28
28
13
28
1.94
14773409--14773512
46
2.3
46
91
0
163
25
25
14
34
1.94
14773409--14773542
46
2.9
46
84
2
135
24
25
16
33
1.96
14778057--14778081
5
5.0
5
100
0
50
80
20
0
0
0.72
14781287--14781391
51
2.0
52
82
8
126
44
3
3
47
1.39
14781636--14781713
33
2.3
33
93
4
129
51
1
7
39
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14787409--14787470
29
2.1
29
82
5
72
29
16
6
48
1.70
14795153--14795196
23
1.9
23
85
0
61
29
2
6
61
1.34
14799577--14799621
24
2.0
22
95
0
63
40
17
20
22
1.92
14799788--14799863
37
2.1
37
100
0
152
30
10
25
34
1.89
14801649--14801753
51
2.1
51
98
0
201
28
8
14
48
1.73
14803167--14803211
2
23.5
2
88
8
67
53
0
0
46
1.00
14804468--14804508
21
2.0
21
85
0
55
29
14
9
46
1.77
14804978--14805002
8
3.1
8
100
0
50
0
12
0
88
0.53
14805319--14805358
6
6.7
6
97
0
62
0
45
32
22
1.53
14808055--14808108
3
19.3
3
77
11
53
62
0
37
0
0.95
14808062--14808104
14
3.1
14
83
10
61
62
0
37
0
0.95
14808067--14808108
20
2.0
20
90
9
66
59
0
40
0
0.97
14808132--14808156
6
4.2
6
100
0
50
84
0
16
0
0.63
14808612--14808689
16
4.9
15
72
10
57
70
5
5
19
1.25
14808655--14808688
17
1.9
18
94
5
61
76
5
5
11
1.14
14808724--14809259
150
3.6
147
89
4
767
58
8
5
27
1.50
14808911--14808952
22
2.0
21
86
13
59
69
9
0
21
1.17
14809172--14809208
13
2.8
13
87
0
56
70
2
5
21
1.20
14811518--14811618
50
2.0
50
94
0
175
22
30
17
28
1.97
14811888--14811970
26
3.0
26
70
24
80
48
10
2
38
1.51
14811919--14811976
17
3.2
17
71
17
53
46
12
6
34
1.68
14815212--14815342
39
3.3
39
75
10
113
48
10
5
35
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14815215--14815342
42
3.2
40
76
11
120
48
10
5
35
1.62
14815300--14815367
25
2.7
26
93
2
111
50
7
8
33
1.61
14815360--14815407
23
2.1
23
88
7
71
68
16
2
12
1.29
14815369--14815415
22
2.1
22
84
4
58
68
17
4
10
1.35
14815753--14815786
18
1.9
17
88
5
50
14
0
5
79
0.91
14826556--14826597
22
2.0
21
85
4
57
59
14
9
16
1.60
14834558--14834602
21
2.1
21
83
0
54
35
4
4
55
1.40
14834566--14834609
21
2.1
21
91
0
70
27
2
9
61
1.38
14839429--14839471
18
2.3
19
80
15
54
67
6
0
25
1.15
14839645--14839715
32
2.1
34
84
5
92
70
7
14
8
1.33
14840126--14840182
29
1.9
30
89
3
89
35
5
8
50
1.56
14840626--14840703
9
9.1
9
76
10
74
51
14
0
34
1.42
14840634--14840700
16
4.1
16
81
7
80
52
14
0
32
1.43
14840621--14840705
34
2.5
34
90
0
125
51
15
0
32
1.43
14840634--14840690
25
2.3
24
82
11
62
52
14
0
33
1.41
14840686--14840795
31
3.6
31
95
2
197
48
12
3
35
1.59
14847251--14847315
28
2.4
27
79
7
69
30
24
13
30
1.94
14847738--14847801
26
2.4
27
78
2
76
29
15
23
31
1.95
14849052--14849607
274
2.0
276
96
2
1035
24
32
14
28
1.95
14855155--14855261
43
2.5
43
85
0
142
28
11
25
35
1.90
14856270--14856338
37
1.9
35
88
8
104
37
2
0
59
1.12
14856531--14856592
18
3.5
18
74
12
65
50
1
8
40
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14857921--14857954
16
2.1
17
88
5
52
73
2
2
20
1.09
14858173--14858206
11
3.0
11
83
8
50
76
0
0
23
0.79
14858022--14858415
153
2.6
147
87
7
576
59
8
5
26
1.48
14858368--14858404
18
2.0
19
85
15
51
72
13
0
13
1.11
14860593--14860769
66
2.7
66
78
3
160
19
37
16
26
1.92
14867313--14867559
128
1.9
128
93
0
422
30
18
18
32
1.95
14873719--14873760
21
2.0
21
82
13
52
26
9
4
59
1.48
14874087--14874123
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
14874253--14874343
44
2.1
44
87
0
128
47
5
9
37
1.60
14874569--14874611
21
2.0
23
86
9
63
44
2
2
51
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311