Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  308  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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2.4
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14
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0
2
28
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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100898156--100898217
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1.9
18
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5
52
14
2
8
73
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100950856--100950940
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42
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11
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1.74
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11
36
1.84
100993222--100993314
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
100993669--100993716
3
16.0
3
82
0
60
58
6
0
35
1.23
100993670--100993718
18
2.7
18
93
0
80
55
8
0
36
1.30
100993669--100993716
12
4.0
12
91
0
69
58
6
0
35
1.23
100994423--100994462
20
2.0
20
85
9
55
2
15
5
77
1.04
100994593--100994660
31
2.3
28
78
9
73
41
2
1
54
1.24
100994639--100994677
21
1.9
20
84
5
51
46
2
0
51
1.14
101006799--101006878
39
2.1
39
100
0
160
41
10
0
48
1.36
101008019--101008079
31
2.0
30
87
6
88
29
0
13
57
1.36
101008041--101008099
29
2.0
29
83
3
73
32
3
10
54
1.51
101008202--101008298
31
3.2
30
76
5
106
47
11
6
35
1.65
101009231--101009297
30
2.3
28
77
7
71
49
1
2
46
1.26
101017815--101018069
39
6.5
39
91
3
388
19
22
28
29
1.98
101017782--101018069
117
2.5
116
85
6
386
19
23
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101017782--101018069
78
3.7
77
86
8
386
19
23
28
28
1.98
101029873--101029907
15
2.4
15
95
4
63
34
0
0
65
0.93
101034202--101034237
16
2.2
16
90
5
54
16
5
11
66
1.40
101036541--101036577
11
3.6
11
79
20
53
51
0
5
43
1.24
101036540--101036581
19
2.2
19
100
0
84
54
0
4
40
1.21
101040733--101040769
11
3.6
11
79
20
53
51
0
5
43
1.24
101040732--101040770
19
2.1
19
100
0
78
53
0
5
41
1.23
101042172--101042201
12
2.6
11
90
10
51
73
0
0
26
0.84
101043314--101043780
155
2.9
167
80
8
589
30
11
16
41
1.84
101045179--101045257
30
2.6
30
83
4
95
44
1
1
53
1.16
101045204--101045280
32
2.4
30
82
8
82
41
2
2
53
1.28
101047473--101047548
38
2.0
38
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0
143
51
14
5
28
1.64
101047479--101047542
18
3.4
18
68
8
56
53
12
4
29
1.59
101068053--101068386
167
2.0
167
95
1
607
16
23
21
38
1.93
101088122--101088800
205
3.3
204
88
4
973
40
18
13
28
1.88
101093603--101093667
33
2.0
33
87
6
96
44
30
6
18
1.74
101095607--101095654
23
2.1
23
88
0
69
33
6
12
47
1.66
101099593--101099627
17
2.1
17
100
0
70
28
54
0
17
1.43
101100651--101100785
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
101102344--101102379
5
7.0
5
93
6
63
61
0
0
38
0.96
101103121--101103178
14
3.9
14
73
10
53
15
5
6
72
1.24
101103190--101103232
22
2.0
22
86
9
61
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101105928--101105959
15
2.0
17
88
11
50
62
18
3
15
1.45
101115872--101115933
31
2.0
30
84
3
79
54
6
1
37
1.36
101115897--101115957
25
2.5
25
81
2
61
57
8
0
34
1.29
101119248--101119333
29
2.9
29
74
6
84
44
1
1
53
1.15
101132617--101132688
33
2.2
33
84
0
90
25
30
9
34
1.88
101137427--101137463
19
1.9
19
88
0
56
54
24
5
16
1.63
101139165--101139239
29
2.5
29
82
4
87
36
14
1
48
1.53
101144121--101144175
27
2.0
27
100
0
110
14
21
27
36
1.93
101150630--101150682
16
3.2
16
94
5
97
24
0
37
37
1.56
101150663--101150753
45
2.0
45
85
2
121
27
6
28
37
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311