Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  228  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
1.26
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2
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1.94
77481777--77482019
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2.1
49
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2.1
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2.2
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.17
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144
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2
2
59
1.25
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1.25
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2
142
36
11
6
45
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77580717--77580785
35
1.9
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1
1
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1.11
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2.5
17
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2
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23
1.18
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19
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20
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2.9
18
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0
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2
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19
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20
73
13
81
30
4
1
64
1.19
77584116--77584228
53
2.2
49
81
10
120
32
4
1
61
1.26
77584201--77584284
27
3.0
27
78
14
80
30
2
1
65
1.13
77584172--77584259
40
2.2
41
81
6
108
30
4
1
63
1.21
77584241--77584284
12
3.4
12
77
17
52
36
0
2
61
1.09
77584383--77584555
89
2.0
89
89
3
269
30
9
21
37
1.86
77584711--77584759
24
2.0
24
92
0
80
46
6
30
16
1.71
77589593--77589620
14
2.0
14
100
0
56
21
21
7
50
1.72
77598242--77598279
19
2.0
20
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5
51
26
7
13
52
1.67
77598803--77598975
47
3.7
47
80
7
174
24
21
17
35
1.95
77603837--77603928
40
2.3
40
85
7
125
25
30
18
26
1.98
77604940--77604964
12
2.1
12
100
0
50
32
32
0
36
1.58
77611256--77611348
40
2.3
40
87
7
127
23
31
19
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77615155--77615193
19
2.0
20
90
10
62
5
20
7
66
1.36
77616055--77616100
22
2.1
22
100
0
92
28
0
26
45
1.54
77619634--77619693
29
2.1
29
87
3
86
50
5
5
40
1.46
77621979--77622774
327
2.4
331
82
10
933
22
13
19
44
1.86
77621979--77622800
167
4.9
165
77
12
774
22
13
20
44
1.85
77624565--77624589
12
2.1
12
100
0
50
24
8
36
32
1.84
77625079--77625123
11
4.1
11
79
0
54
46
2
0
51
1.13
77631479--77631569
46
2.0
46
100
0
182
27
6
10
54
1.60
77631579--77631665
17
5.2
17
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8
72
31
5
1
62
1.26
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23
2.7
23
80
4
65
34
3
0
61
1.12
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19
2.6
19
93
0
80
34
6
0
59
1.22
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17
3.1
17
71
5
54
31
0
7
61
1.24
77635640--77635689
14
3.5
15
80
20
54
24
22
10
44
1.83
77640109--77640359
124
2.0
124
99
0
493
36
15
24
23
1.93
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210
3.7
210
85
3
987
30
18
21
28
1.97
77646232--77646318
17
5.2
17
73
8
72
32
5
1
60
1.27
77646433--77646497
26
2.7
24
80
15
71
32
4
0
63
1.15
77646452--77646552
19
5.7
19
73
17
85
30
5
1
61
1.31
77646616--77646679
18
3.5
19
70
18
55
29
0
6
64
1.18
77653642--77653718
40
1.9
40
91
0
127
53
6
5
35
1.49
77655718--77655767
15
3.3
15
78
15
50
40
4
2
54
1.31
77676515--77676584
35
2.0
35
97
0
131
18
37
18
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77677530--77677593
30
2.1
29
81
13
76
48
9
3
39
1.51
77680050--77680223
89
2.0
89
96
0
321
43
12
13
30
1.81
77683255--77683377
47
2.6
48
83
6
137
26
26
17
30
1.97
77691113--77691201
3
28.7
3
74
15
65
26
10
2
60
1.40
77700913--77701060
79
1.9
79
84
2
199
33
10
14
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1.80
77704384--77704426
12
3.2
13
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52
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0
2
27
1.00
77704330--77704453
65
1.9
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4
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15
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1.93
77707233--77707448
89
2.4
89
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1
272
30
19
16
33
1.94
77707421--77707882
51
9.5
51
73
11
375
31
20
15
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311