Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  99  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Number
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Percent
Indels
Score
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Period
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Score
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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25
16
12
45
1.83
32891942--32892003
5
12.0
5
74
19
56
3
19
1
75
1.02
32891944--32892003
11
5.7
11
74
14
56
3
18
1
76
1.00
32891943--32892013
36
2.0
36
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10
101
2
19
2
74
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32891960--32891997
20
1.9
20
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0
67
0
21
2
76
0.91
32891955--32892010
25
2.2
25
84
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69
1
19
3
75
1.05
32892917--32892960
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72
1.27
32892917--32892959
21
2.0
21
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2
7
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30
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30
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8
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28
16
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27
1.97
32895144--32895190
20
2.3
20
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0
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25
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17
23
1.96
32895155--32895192
10
3.8
10
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13
51
28
28
15
26
1.96
32905129--32905159
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32905218--32905271
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2.1
26
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13
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1
18
3
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1.03
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19
2.3
20
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23
34
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23
1.96
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10
5.7
10
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11
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29
27
13
29
1.94
32912188--32912248
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
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1.93
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22
2.0
22
100
0
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31
4
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27
1.77
32926430--32926477
20
2.4
20
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0
51
33
18
27
20
1.96
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2.7
12
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0
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18
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0
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1
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6
69
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6
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0
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20
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3.2
30
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2
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28
15
26
28
1.96
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2.1
22
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1.91
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30
2.8
30
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12
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1.34
32941710--32941796
12
7.2
12
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59
12
20
1
65
1.32
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5
11.0
5
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20
55
3
17
1
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1.00
32941865--32941921
16
3.7
14
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3
17
1
77
1.00
32941863--32941932
20
3.3
20
73
18
63
2
18
2
75
1.05
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3.2
30
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29
16
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11
2.4
11
100
0
52
50
7
7
34
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32947568--32947630
18
3.4
18
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17
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0
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2.3
20
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8
84
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1
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15
1.06
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4.9
13
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20
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0
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1.97
32970794--32970824
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311