Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  306  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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88
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0
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3.2
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1.59
100034971--100035065
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3.2
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2
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1.48
100034968--100035091
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2.0
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3
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.21
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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0
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90
60
4
3
31
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100203959--100204019
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0
12
36
1.39
100244293--100244354
31
2.0
31
90
6
99
50
6
4
38
1.50
100267467--100267519
15
3.7
15
82
7
65
26
9
1
62
1.36
100268267--100268309
22
2.0
21
86
13
61
27
6
2
62
1.33
100270196--100270263
28
2.3
29
77
7
75
57
4
2
35
1.34
100272770--100272884
61
1.9
61
100
0
230
33
15
17
33
1.91
100279823--100279866
22
2.0
23
81
4
54
34
0
4
61
1.16
100285113--100285160
21
2.2
22
85
7
62
66
10
14
8
1.43
100285695--100285720
11
2.4
11
100
0
52
92
0
0
7
0.39
100287474--100287523
26
2.0
25
92
4
82
32
32
12
24
1.91
100288553--100288607
26
2.1
27
83
6
69
36
5
7
50
1.53
100290993--100291058
31
2.1
31
83
5
80
36
7
12
43
1.70
100298997--100299030
2
17.0
2
93
0
59
0
0
47
52
1.00
100303884--100303917
13
2.5
13
90
4
50
32
0
2
64
1.08
100304348--100304388
18
2.3
18
87
8
57
58
2
12
26
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100306523--100306583
24
2.5
25
81
10
72
59
8
0
32
1.27
100308114--100308156
21
2.1
21
87
8
63
72
0
2
25
0.97
100315950--100316157
104
2.0
104
96
0
380
33
6
11
48
1.65
100317669--100317874
104
2.0
104
90
2
326
36
18
15
29
1.92
100326119--100326159
21
2.0
20
85
4
55
36
0
2
60
1.10
100330216--100330252
13
2.9
13
92
4
58
24
0
0
75
0.80
100332932--100333093
52
3.3
50
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8
163
24
14
29
31
1.95
100335265--100335303
20
2.0
19
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14
53
28
0
5
66
1.12
100335609--100335650
22
2.0
22
85
4
59
64
0
14
21
1.29
100335609--100335653
21
2.1
21
84
8
56
66
0
13
20
1.24
100345776--100345898
12
10.2
12
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3
122
66
0
32
0
0.97
100345776--100345897
48
2.5
48
84
2
174
66
0
32
0
0.98
100345793--100345898
36
3.0
36
84
1
142
66
0
32
0
0.98
100347081--100347162
28
2.9
28
83
3
101
36
7
3
52
1.47
100347512--100347592
41
1.9
42
87
9
121
38
16
2
43
1.61
100350518--100350548
6
5.2
6
96
0
53
0
38
16
45
1.47
100359263--100359729
156
3.0
154
84
3
621
26
23
20
28
1.99
100375722--100375762
19
2.2
19
86
8
57
68
4
2
24
1.22
100380777--100380828
4
13.0
4
95
0
95
51
25
0
23
1.48
100382010--100382263
125
2.0
125
98
0
490
38
14
11
35
1.82
100387431--100387490
28
2.1
28
84
6
77
38
0
6
55
1.27
100406683--100406909
123
1.8
123
83
1
303
26
10
18
44
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100408148--100408215
32
2.2
32
97
2
129
42
17
5
33
1.74
100422588--100422612
9
2.8
9
100
0
50
56
0
0
44
0.99
100434184--100434273
34
2.6
36
91
7
150
32
15
24
27
1.95
100434184--100434273
17
5.2
18
88
6
132
32
15
24
27
1.95
100438407--100438535
50
2.5
51
90
5
199
35
16
22
25
1.94
100438511--100438690
31
5.8
31
91
2
281
27
20
27
25
1.99
100438715--100438838
47
2.7
46
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2
158
29
16
25
29
1.96
100438809--100438923
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2.7
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4
162
31
14
26
27
1.95
100443346--100443415
33
2.2
31
85
7
88
45
10
10
34
1.71
100447715--100447749
16
2.2
16
94
0
61
31
25
31
11
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311