Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  18  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5053190--5053243
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2.1
19
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2.3
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0
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2
0
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.2
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229
27
15
27
29
1.96
5176394--5176571
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
5176395--5176550
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
5176391--5176571
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
5179154--5179378
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3
69
16
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28
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3
59
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2.0
24
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6
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20
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1.22
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1.9
26
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1
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0
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0
0
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0
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51
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0
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11
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14
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0
7
16
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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14
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19
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0
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1.30
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3.0
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21
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1.74
5217368--5217602
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6.1
39
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285
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4
22
42
1.73
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1
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5.3
116
96
1
1115
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3
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1.78
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11
20
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32
1.9
33
86
3
90
74
3
19
3
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5258757--5258791
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1.9
18
100
0
70
34
14
22
28
1.93
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19
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18
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53
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10
12
30
1.74
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2.0
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100
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1.65
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2.3
23
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13
68
66
2
2
29
1.14
5264077--5264129
21
2.6
20
88
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72
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1
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0
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0
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21
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26
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0
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3
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1
0
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10.6
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13
73
36
4
0
60
1.16
5299695--5299865
42
3.7
44
75
18
129
34
5
0
59
1.26
5306533--5306634
50
2.0
50
90
0
159
31
26
20
21
1.98
5307188--5307244
22
2.6
22
77
17
66
73
0
22
3
0.98
5309976--5310018
22
2.0
22
90
4
70
62
2
4
30
1.28
5310037--5310061
12
2.1
12
100
0
50
56
0
0
44
0.99
5310007--5310090
10
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11
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18
58
58
0
5
35
1.23
5310005--5310105
29
3.5
28
75
10
96
60
0
5
33
1.21
5311660--5312103
44
10.1
44
88
0
584
26
26
15
30
1.96
5311660--5312105
219
2.0
220
85
0
606
26
26
15
30
1.96
5314830--5314927
19
5.2
19
92
7
164
37
10
16
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5314820--5314927
36
2.9
35
78
20
112
37
10
15
36
1.82
5320432--5320485
23
2.3
25
75
12
60
66
11
18
3
1.37
5322302--5322627
39
8.3
39
88
1
438
31
20
15
31
1.94
5326718--5326856
48
2.9
48
85
1
181
30
14
22
33
1.93
5326820--5326896
38
2.0
38
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0
127
28
14
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29
1.95
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50
2.2
50
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0
215
33
10
10
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1.74
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5.8
5
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7
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20
0
0
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6
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6
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0
52
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1
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9
1.02
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2.2
18
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0
60
82
2
7
7
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17
2.0
17
100
0
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17
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1.85
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2.2
31
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0
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22
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1.94
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25
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5
125
29
18
22
30
1.97
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25
3.9
25
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5
128
31
18
23
26
1.97
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20
2.2
20
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8
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36
15
11
36
1.84
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38
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1.90
5359395--5359508
31
3.5
31
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8
120
27
21
12
38
1.89
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25
2.4
26
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11
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30
20
18
30
1.96
5359719--5359802
25
3.3
26
82
9
86
28
21
20
29
1.98
5359850--5359896
20
2.3
20
92
7
78
34
19
10
36
1.86
5359932--5359979
25
1.9
25
86
0
69
29
16
20
33
1.95
5371402--5371491
45
2.0
45
100
0
180
31
11
15
42
1.82
5371970--5372012
19
2.4
19
88
7
63
37
13
11
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5371978--5372014
19
1.9
19
100
0
74
37
10
16
35
1.83
5371978--5372037
19
2.8
22
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9
72
36
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16
38
1.79
5372304--5372338
18
2.0
17
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5
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31
0
0
68
0.90
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2.3
19
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4
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2
2
27
1.15
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50
2.3
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114
58
0
3
36
1.21
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20
8.9
20
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1
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13
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2
0
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25
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1
0
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118
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1
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1.23
5384113--5384171
27
2.2
26
85
8
75
61
1
1
35
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311