Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  4  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1094906--1094966
30
2.0
30
90
0
95
27
6
9
55
1.57
1105745--1105778
16
2.1
16
100
0
68
44
5
5
44
1.52
1105788--1105998
55
3.8
55
74
17
191
32
20
16
30
1.95
1106653--1106703
24
2.1
25
82
7
61
17
5
7
68
1.34
1107401--1107446
19
2.4
18
82
10
56
63
6
0
30
1.20
1110731--1110817
29
2.8
32
72
18
85
37
9
0
52
1.33
1110756--1110817
29
2.1
29
88
5
90
35
8
0
56
1.29
1112410--1112452
22
1.9
23
86
13
63
30
6
4
58
1.45
1112488--1112558
29
2.4
30
75
15
76
28
7
4
60
1.42
1112635--1112836
26
8.0
24
71
15
113
28
7
5
57
1.51
1112635--1112839
76
2.6
79
78
3
209
28
7
5
57
1.50
1122797--1122869
31
2.4
30
79
4
83
35
5
19
39
1.75
1125022--1125050
9
3.3
9
90
9
51
48
0
0
51
1.00
1125031--1125075
21
2.1
21
84
8
56
37
0
2
60
1.09
1130951--1131007
3
19.0
3
92
0
78
26
0
7
66
1.17
1131279--1131310
17
1.9
16
93
6
55
50
6
6
37
1.53
1140097--1140253
39
4.0
39
79
6
133
27
28
22
21
1.99
1141531--1141868
132
2.6
131
85
4
421
27
19
20
32
1.97
1148887--1148925
11
3.5
11
78
0
51
58
7
12
20
1.58
1148879--1148921
22
2.0
22
95
0
77
58
6
11
23
1.57
1148878--1148934
22
2.6
22
83
5
62
61
5
12
21
1.50
1151163--1151209
24
1.9
25
83
12
62
46
0
2
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1152478--1152523
11
4.1
11
84
15
67
63
0
0
36
0.95
1152491--1152553
31
2.1
30
82
8
74
58
1
1
38
1.17
1152477--1152554
23
3.6
22
66
23
58
58
1
1
38
1.14
1153246--1153284
13
2.7
15
84
15
55
64
0
0
35
0.94
1156239--1156271
16
2.1
16
88
11
50
69
0
9
21
1.15
1156239--1156272
17
2.1
16
88
5
50
70
0
8
20
1.13
1158842--1158884
16
2.7
16
74
0
50
34
2
0
62
1.08
1159234--1159368
60
2.2
60
97
0
261
34
20
22
22
1.97
1160763--1160842
40
2.0
40
95
0
142
33
5
17
43
1.71
1162806--1162849
22
2.0
22
86
0
61
52
0
0
47
1.00
1162873--1162909
16
2.3
17
81
13
51
59
2
0
37
1.12
1162942--1162997
15
3.5
15
71
19
51
50
1
0
48
1.11
1165573--1165771
35
5.7
35
87
1
285
27
12
23
36
1.91
1165573--1165771
69
2.9
69
88
0
299
27
12
23
36
1.91
1165580--1165771
104
1.8
104
89
2
305
26
12
23
37
1.90
1174634--1174667
12
2.9
12
86
4
52
32
0
0
67
0.91
1176618--1176647
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
1179689--1179776
7
13.0
7
84
7
83
65
0
0
34
0.93
1179681--1179765
15
5.3
15
71
19
55
71
0
0
28
0.86
1181369--1181700
114
2.9
113
90
3
520
50
15
1
32
1.51
1181607--1181780
101
1.8
90
83
15
226
50
15
0
34
1.45
1181970--1182007
3
12.3
3
88
5
58
0
36
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1181972--1182011
19
2.2
18
90
4
62
0
40
0
60
0.97
1183874--1183898
8
3.1
8
100
0
50
24
52
12
12
1.72
1184087--1184125
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
1184172--1184224
13
4.0
13
81
11
63
73
3
0
22
0.99
1187128--1187170
9
4.7
9
80
13
52
32
2
0
65
1.06
1187147--1187191
21
2.0
23
87
8
67
33
2
0
64
1.06
1187398--1187462
17
3.9
16
79
15
78
73
1
0
24
0.91
1187398--1187472
9
8.7
9
75
16
70
73
1
0
25
0.91
1187405--1187462
25
2.3
24
82
8
80
74
1
0
24
0.92
1187439--1187550
19
5.8
20
65
17
65
65
3
6
25
1.32
1188042--1188070
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
1190248--1190290
9
4.7
9
80
13
52
32
2
0
65
1.06
1190267--1190311
21
2.0
23
87
8
67
33
2
0
64
1.06
1190517--1190604
19
4.6
20
78
15
96
69
3
0
27
1.04
1190536--1190601
18
3.8
17
76
20
66
69
3
0
27
1.03
1190529--1190588
9
6.6
9
78
19
54
70
5
0
25
1.08
1190529--1190601
36
2.0
36
89
5
112
69
4
0
26
1.06
1190767--1190841
27
2.7
27
76
17
73
37
2
1
58
1.20
1191095--1191120
5
5.2
5
100
0
52
80
0
0
19
0.71
1191171--1191209
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
1194819--1194876
29
2.0
29
100
0
116
27
17
20
34
1.95
1196818--1196847
6
5.0
6
100
0
60
33
16
16
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1197027--1197060
7
4.9
7
88
0
50
26
5
14
52
1.64
1197697--1197753
6
8.9
7
90
5
70
54
0
29
15
1.42
1200379--1200585
47
4.2
48
81
5
195
24
16
28
29
1.97
1203122--1203260
60
2.3
60
85
6
183
28
19
25
26
1.99
1203160--1203265
28
3.7
27
70
25
74
27
18
27
26
1.98
1205402--1205469
24
2.7
26
84
4
95
23
22
19
35
1.96
1206115--1206163
19
2.7
17
75
12
53
26
0
22
51
1.49
1207010--1207057
17
2.5
21
80
16
59
25
0
27
47
1.52
1214556--1214670
23
4.8
24
79
13
114
23
22
20
33
1.97
1217603--1217702
42
2.4
42
84
3
130
32
17
22
29
1.96
1217605--1217760
85
1.8
84
81
9
192
31
16
22
29
1.96
1222170--1222227
18
3.4
18
72
18
61
44
18
5
31
1.72
1222413--1222502
44
2.0
44
82
4
110
34
24
18
22
1.96
1223387--1223423
5
7.6
5
85
14
51
56
0
0
43
0.99
1223392--1223417
13
2.0
13
100
0
52
61
0
0
38
0.96
1223387--1223422
18
1.9
19
94
5
65
58
0
0
41
0.98
1223406--1223491
47
1.9
42
84
11
109
54
4
0
40
1.21
1229219--1229250
8
4.0
8
95
0
55
59
0
3
37
1.13
1234117--1234260
60
2.4
60
82
8
168
28
26
18
26
1.98
1241345--1241383
2
19.0
2
89
5
60
46
2
2
48
1.29
1241992--1242034
21
2.1
20
86
4
59
41
4
16
37
1.69
1242591--1242659
19
3.7
19
72
18
72
17
15
18
47
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1243668--1243703
18
2.0
18
94
0
63
38
44
2
13
1.59
1243732--1243771
6
6.5
6
88
5
53
77
5
0
17
0.94
1243732--1243771
19
2.2
18
81
4
53
77
5
0
17
0.94
1243791--1243849
9
6.6
9
78
0
64
28
10
18
42
1.83
1244382--1244435
27
2.0
27
96
0
99
24
3
14
57
1.54
1244725--1244788
23
2.7
23
71
19
60
57
0
0
42
0.98
1248371--1248415
19
2.3
20
81
11
58
66
4
2
26
1.22
1251327--1251356
14
2.1
14
93
0
51
46
0
23
30
1.52
1252522--1252587
31
2.1
31
82
0
78
28
24
19
27
1.99
1252599--1252825
50
4.5
50
91
0
346
27
22
14
34
1.94
1257870--1257978
26
4.1
26
80
10
112
67
1
4
25
1.19
1257883--1257932
18
2.8
18
78
3
57
68
4
4
24
1.24
1257955--1258008
21
2.6
20
80
13
56
59
1
3
35
1.26
1258862--1258918
9
6.2
9
78
17
64
33
1
0
64
1.04
1258862--1259037
9
18.5
10
65
20
51
36
3
3
56
1.33
1258964--1259044
19
4.3
19
78
9
76
35
3
2
58
1.29
1268264--1268333
34
2.1
34
100
0
140
44
21
11
22
1.84
1269762--1269819
21
2.8
20
84
7
71
34
6
6
51
1.55
1270130--1270192
33
1.9
32
83
6
81
26
4
3
65
1.28
1272936--1273007
37
1.9
37
100
0
144
31
23
19
25
1.98
1275177--1275232
19
2.9
18
77
17
60
53
1
0
44
1.11
1275249--1275287
10
3.8
10
81
18
53
69
0
2
28
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1275218--1275268
23
2.2
24
82
3
59
54
3
0
41
1.19
1275363--1275396
3
11.3
3
100
0
68
32
0
0
67
0.91
1278714--1278751
12
3.7
10
83
16
51
44
0
0
55
0.99
1278723--1278748
12
2.2
12
100
0
52
38
0
0
61
0.96
1279405--1279461
21
2.7
21
94
2
96
33
10
14
42
1.79
1288829--1288957
63
2.0
63
93
0
222
28
17
17
35
1.93
1295169--1295212
5
8.8
5
94
0
79
59
0
2
38
1.10
1295169--1295229
10
6.0
10
84
3
50
57
3
1
37
1.25
1313548--1313654
51
2.1
51
87
0
151
33
9
35
21
1.86
1325047--1325087
19
2.1
20
86
4
57
48
7
9
34
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311