Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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17
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35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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90
12
23
1
62
1.37
80854189--80854263
39
1.9
39
97
0
141
10
24
1
64
1.33
80854910--80854958
21
2.3
22
92
3
82
24
12
4
59
1.50
80854926--80854965
21
1.9
21
84
0
53
32
12
2
52
1.52
80857457--80857499
16
2.8
16
80
13
54
48
2
0
48
1.14
80863234--80863284
10
5.1
10
79
13
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41
3
0
54
1.19
80863235--80863292
20
3.0
20
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12
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37
3
0
58
1.15
80863807--80863846
20
2.0
21
85
5
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75
2
2
20
1.04
80875837--80875893
18
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18
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0
7
31
1.23
80886281--80886337
27
2.2
24
84
15
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5
5
35
1.46
80887046--80887248
79
2.5
80
88
4
295
30
21
2
44
1.67
80887051--80887248
40
5.0
40
93
2
285
30
20
3
45
1.66
80888358--80888382
13
1.9
13
100
0
50
8
28
16
48
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80888365--80888711
44
7.9
44
78
9
350
26
24
17
31
1.97
80888372--80888768
88
4.5
87
75
9
292
26
24
17
31
1.97
80888365--80888753
133
3.0
132
93
1
656
26
24
17
31
1.97
80888817--80889795
205
4.8
205
91
1
1511
30
22
17
29
1.97
80897793--80897842
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
80900418--80900513
39
2.5
40
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15
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4
12
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1.59
80908092--80908122
15
2.1
15
100
0
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6
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0
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15
3.5
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15
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42
8
24
26
1.82
80911807--80911863
27
2.2
24
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5
5
35
1.46
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40
3.9
41
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3
244
30
18
3
47
1.65
80912576--80912732
79
2.0
79
87
6
201
30
19
3
47
1.65
80915105--80915144
20
2.1
19
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9
55
25
12
5
57
1.55
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23
2.8
21
80
15
65
23
3
4
68
1.23
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17
2.4
16
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25
0
2
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0.98
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12
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41
6
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44
1.58
80934064--80934101
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6
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10
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2.3
14
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0
55
37
25
28
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1.87
80942584--80942623
21
1.9
21
84
0
53
27
5
27
40
1.77
80946127--80946640
44
11.7
44
70
11
297
36
22
21
19
1.95
80946248--80946646
132
3.0
131
72
9
355
37
22
21
18
1.95
80946095--80946646
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6.3
86
80
6
540
36
22
21
19
1.95
80947080--80947124
18
2.5
18
81
0
63
46
37
2
13
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80948387--80948443
20
2.6
21
78
13
53
40
8
3
47
1.52
80955034--80955072
19
2.0
20
90
5
62
20
0
7
71
1.10
80955053--80955098
25
1.9
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2
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1.38
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9
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9
83
0
91
45
19
7
27
1.77
80965811--80965888
27
2.9
27
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0
102
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19
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0
0
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1.00
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29
6
29
1.83
80978719--80978773
16
3.4
16
85
5
76
27
27
9
36
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311