Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  220  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
30
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14
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3.5
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13
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1.93
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20
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0
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10
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5
6
61
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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2.8
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2.2
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4
57
1.44
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2.3
24
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14
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87
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15
11
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16
17
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16
20
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1.94
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16
20
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1.94
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27
16
18
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2.3
30
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1.9
19
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0
75
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75321633--75321699
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0
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1.14
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89
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89
73
9
299
31
16
21
29
1.96
75363493--75363671
96
1.9
96
83
2
234
33
14
20
31
1.93
75363591--75363810
44
5.0
44
77
6
167
30
16
22
30
1.96
75365718--75365752
18
1.9
18
88
0
52
28
20
17
34
1.95
75365744--75365790
24
2.0
22
84
8
58
46
6
14
31
1.70
75365787--75365824
20
1.9
20
94
0
67
39
5
15
39
1.70
75366979--75367597
44
13.7
45
71
12
292
31
16
21
29
1.96
75367302--75367597
89
3.3
89
81
3
312
30
16
22
29
1.96
75369216--75369241
9
2.9
9
100
0
52
34
7
0
57
1.27
75372818--75372844
13
2.1
13
100
0
54
22
0
7
70
1.12
75373353--75373381
12
2.4
12
100
0
58
65
0
0
34
0.93
75379909--75380069
43
3.7
43
76
14
170
24
18
27
29
1.98
75380892--75380939
8
5.9
8
79
20
55
62
2
0
35
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75380912--75380938
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2.1
13
100
0
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0
0
37
0.95
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7
3.7
7
100
0
52
15
26
15
42
1.87
75382774--75382806
13
2.5
13
90
0
57
21
36
39
3
1.69
75387918--75387955
20
2.0
20
89
5
60
39
2
13
44
1.57
75392759--75392785
4
6.8
4
100
0
54
51
0
0
48
1.00
75395966--75396010
22
2.0
22
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0
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33
13
8
44
1.75
75396339--75396384
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1.9
25
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30
10
4
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1.55
75397116--75397146
13
2.4
13
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0
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0
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17
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0
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0
24
0
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0.80
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22
2.1
23
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4
0
35
1.16
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2.1
44
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0
112
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21
19
23
1.96
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2.8
12
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13
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0
23
0
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3
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3
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59
2
0
38
1.09
75400446--75400490
16
2.8
16
86
3
63
60
2
0
37
1.09
75400442--75400491
13
3.6
14
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20
61
58
2
0
40
1.10
75401109--75401150
11
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11
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42
23
0
33
1.55
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2.1
48
80
15
124
19
15
35
29
1.92
75409210--75409267
24
2.3
25
80
17
66
44
17
5
32
1.70
75417634--75417678
21
2.1
22
84
12
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64
0
0
35
0.94
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14
3.1
14
79
11
56
56
0
0
43
0.99
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12.3
3
94
0
65
32
35
0
32
1.58
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12
3.0
12
87
4
54
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75430119--75430182
30
2.2
29
88
8
94
59
9
1
29
1.38
75430207--75430280
14
5.1
14
73
22
55
71
4
1
22
1.10
75430207--75430288
22
3.7
22
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12
71
70
3
1
24
1.10
75430207--75430282
36
2.2
32
84
9
89
71
3
1
23
1.11
75434139--75434176
13
2.8
14
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39
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31
1.77
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14.7
3
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0
70
63
0
4
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1.14
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2.0
21
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0
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0
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0
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17
2.4
17
84
11
50
55
0
4
39
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311