Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  275  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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0
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28
28
1.91
90788796--90788861
20
3.0
22
66
12
55
39
0
1
59
1.07
90789264--90789347
40
2.1
40
88
0
123
61
11
11
14
1.56
90792131--90792247
25
4.7
25
72
12
62
58
5
5
30
1.41
90792388--90792497
29
3.8
28
72
14
82
65
0
9
24
1.27
90797008--90797033
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
90797088--90797348
41
6.4
41
91
2
400
32
21
26
19
1.97
90797962--90798010
24
2.0
24
96
0
89
53
2
4
40
1.32
90798292--90798444
7
21.6
7
75
7
76
21
0
32
45
1.57
90798318--90798423
21
5.0
21
76
7
90
19
0
36
42
1.58
90798566--90798632
14
4.7
14
85
3
89
40
4
16
38
1.69
90799182--90799245
22
2.9
23
77
15
71
64
3
3
29
1.24
90799253--90799358
38
2.7
40
86
5
162
41
19
20
17
1.90
90801748--90801781
17
1.9
18
88
5
52
17
2
8
70
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90802369--90802427
9
6.6
9
86
0
82
45
23
1
28
1.63
90802369--90802427
27
2.2
27
90
0
100
45
23
1
28
1.63
90807556--90807650
46
2.1
46
95
0
172
34
4
4
56
1.38
90808504--90808710
43
4.8
44
90
3
305
26
26
21
26
2.00
90814408--90814688
131
2.1
132
80
8
297
35
20
19
24
1.95
90815649--90815684
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
90815942--90815983
18
2.4
19
84
15
63
45
7
11
35
1.69
90820102--90820126
11
2.3
11
100
0
50
24
0
0
76
0.80
90822039--90822098
21
2.8
23
80
9
65
21
0
8
70
1.14
90825158--90825243
30
2.9
30
89
3
129
16
51
6
25
1.69
90825747--90825948
3
65.3
3
68
21
66
30
5
2
61
1.33
90825738--90825816
9
8.6
9
75
15
63
26
2
1
69
1.09
90825736--90825787
15
3.6
14
76
7
50
23
1
0
75
0.91
90825752--90825827
24
3.0
27
72
16
74
31
2
1
64
1.15
90826049--90826090
16
2.6
17
81
11
52
28
0
11
59
1.33
90828102--90828147
19
2.4
19
85
7
58
19
17
13
50
1.78
90836183--90836938
44
17.5
42
66
15
186
34
21
23
20
1.97
90836434--90837270
43
19.4
43
67
12
414
35
22
22
19
1.96
90836119--90837329
87
14.0
87
85
4
1349
35
21
23
20
1.96
90836119--90837329
173
7.0
172
84
6
1305
35
21
23
20
1.96
90837841--90837927
30
2.9
30
92
0
147
17
48
6
27
1.72
90838422--90838499
9
8.6
9
72
17
54
26
3
1
67
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90838429--90838508
12
6.6
12
75
12
74
30
3
1
65
1.18
90840177--90840211
16
2.2
16
90
10
54
37
0
2
60
1.12
90840208--90840354
9
16.4
9
69
14
65
31
3
4
61
1.31
90840401--90840465
26
2.6
26
76
11
64
36
0
4
58
1.19
90842149--90842774
286
2.1
291
85
7
820
32
11
11
44
1.76
90845218--90845269
20
2.7
18
75
16
50
28
5
1
63
1.28
90845243--90845329
15
6.0
14
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12
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26
8
0
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1.20
90845250--90845283
14
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15
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5
52
26
5
0
67
1.13
90845250--90845308
29
2.0
29
81
12
68
27
8
0
64
1.22
90845276--90845321
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          305   306   307   308   309   310   311