Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  311  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101945864--101945891
4
7.0
4
100
0
56
25
0
25
50
1.50
101946086--101946132
24
2.0
24
82
0
58
55
6
12
25
1.61
101946422--101946650
110
2.1
111
93
0
388
41
12
11
34
1.79
101951053--101951082
3
10.0
3
92
0
51
63
3
0
33
1.11
101962998--101963045
25
2.0
24
84
8
62
50
4
2
43
1.33
101963068--101963157
31
2.9
31
76
11
78
46
8
6
37
1.61
101963480--101963512
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
101963560--101963620
30
2.0
30
90
0
95
55
9
4
29
1.53
101971487--101971542
27
2.1
27
100
0
112
51
17
10
19
1.74
101981435--101981496
31
1.9
33
84
12
85
56
4
3
35
1.37
101987048--101987081
18
1.9
18
88
5
52
73
0
14
11
1.10
101989277--101989302
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
102000496--102000534
20
1.9
19
85
10
51
56
5
5
33
1.43
102010689--102010723
7
5.0
7
92
0
61
17
0
40
42
1.49
102016953--102016987
15
2.2
16
90
5
54
54
17
11
17
1.71
102017225--102017285
30
2.0
30
100
0
122
32
13
13
40
1.82
102024843--102024911
33
2.1
33
94
0
120
15
53
17
13
1.73
102026038--102026111
22
3.4
22
74
11
62
27
9
2
60
1.41
102026064--102026103
20
2.0
21
85
5
55
27
12
2
57
1.48
102026014--102026108
3
31.7
3
70
12
52
27
10
2
60
1.41
102026246--102026308
21
3.2
20
78
12
60
26
6
0
66
1.15
102026402--102026432
15
2.1
15
100
0
62
32
6
0
61
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102030181--102030251
36
2.0
36
83
10
92
49
0
1
49
1.09
102039328--102039363
3
12.0
3
87
0
54
0
33
0
66
0.92
102040417--102040498
40
2.0
40
92
0
137
47
15
7
29
1.73
102045631--102045659
13
2.1
14
93
6
51
75
10
6
6
1.17
102046266--102046322
20
3.0
19
80
7
62
50
8
5
35
1.56
102046266--102046304
19
2.0
19
90
5
60
48
10
2
38
1.51
102046453--102046514
33
1.9
33
86
3
90
51
8
4
35
1.53
102056676--102056728
26
2.0
26
96
0
97
32
18
5
43
1.74
102058154--102058179
13
2.0
13
100
0
52
46
0
7
46
1.31
102061056--102061113
29
2.0
29
100
0
116
27
6
17
48
1.72
102061403--102061502
47
2.1
47
87
3
139
25
13
27
35
1.92
102061416--102061571
47
3.3
46
80
12
149
26
12
26
33
1.93
102063975--102064094
38
3.1
38
80
4
143
23
22
22
31
1.98
102073190--102073288
9
10.4
9
73
21
62
65
2
1
31
1.10
102073220--102073288
19
3.6
19
77
14
63
65
2
1
30
1.16
102078606--102078637
17
1.9
16
93
6
55
59
3
0
37
1.13
102078746--102078791
23
2.0
23
83
12
58
41
2
4
52
1.33
102080258--102080291
10
3.3
10
91
4
50
8
14
0
76
1.01
102080258--102080296
11
3.5
11
93
6
62
7
15
0
76
0.99
102084278--102084435
52
3.0
52
80
4
174
30
25
18
25
1.98
102088222--102088321
47
2.1
47
89
5
150
32
25
9
34
1.87
102091117--102091188
18
3.9
18
71
18
58
63
1
4
30
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102091126--102091189
24
2.6
26
83
13
75
65
1
4
28
1.21
102091148--102091196
8
5.7
9
75
15
50
73
0
2
24
0.94
102091581--102091737
13
11.9
13
72
22
107
13
0
48
38
1.43
102091581--102091693
35
3.3
35
86
9
155
13
0
48
38
1.42
102091656--102091746
9
8.8
9
80
17
65
14
0
47
38
1.44
102091622--102091737
44
2.6
44
93
0
205
12
0
47
39
1.42
102091605--102091755
22
6.9
22
74
13
132
14
0
47
38
1.45
102091596--102091755
13
14.2
12
76
21
104
14
0
46
38
1.44
102092002--102092855
44
19.4
44
74
9
695
26
24
18
31
1.97
102092001--102092843
132
6.4
132
92
0
1375
26
24
18
31
1.97
102092008--102092850
397
2.1
397
91
0
1384
26
24
18
31
1.97
102092867--102093355
205
2.4
205
88
1
719
29
20
18
30
1.97
102100828--102106374
7
787.7
7
93
4
8085
12
0
44
42
1.48
102100993--102101018
6
4.3
6
100
0
52
15
0
46
38
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311

The End!