Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  189  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64965506--64965762
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131
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131
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20
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20
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1.99
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20
27
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1.99
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3.0
30
90
6
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27
25
23
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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1.95
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28
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28
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27
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210
26
16
28
29
1.97
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3
215
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16
28
28
1.97
65068584--65068737
55
2.9
52
82
7
175
27
16
27
27
1.97
65068585--65068740
27
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6
163
26
16
28
28
1.97
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101
26
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28
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1.97
65068577--65068761
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2.3
81
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210
26
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32
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0
2
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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95
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51
16
30
0
53
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65154132--65154315
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1.99
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25
1.54
65209567--65209649
30
2.8
30
74
3
87
24
22
18
34
1.96
65210825--65210865
22
1.9
22
85
14
59
58
17
12
12
1.63
65217105--65217175
30
2.3
31
87
2
99
25
26
14
33
1.94
65217389--65217455
24
2.8
24
88
4
73
29
19
22
28
1.98
65217396--65217465
24
2.8
25
86
6
97
28
22
21
27
1.99
65225533--65225574
20
2.2
18
87
8
57
45
7
0
47
1.30
65227849--65228060
40
5.3
40
81
2
223
25
23
26
25
2.00
65235919--65236139
40
5.6
40
82
2
241
25
23
26
24
2.00
65237815--65237963
74
2.0
74
94
2
264
35
10
19
34
1.85
65241153--65241192
21
1.9
21
85
10
55
35
15
5
45
1.68
65244448--65244570
43
2.9
43
91
1
194
29
29
17
23
1.97
65257284--65257430
47
3.1
47
95
0
258
34
11
28
25
1.91
65257284--65257470
94
2.0
94
85
4
252
33
11
29
25
1.91
65257284--65257470
47
4.0
46
80
9
200
33
11
29
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65257458--65257631
46
3.8
46
91
1
260
35
8
30
26
1.85
65259113--65259306
40
4.8
40
90
0
298
21
22
30
25
1.99
65259104--65259306
80
2.5
80
93
0
334
21
22
29
26
1.99
65259478--65259579
28
3.7
28
73
11
102
21
15
33
29
1.94
65262856--65263002
47
3.1
47
95
0
258
34
11
28
25
1.91
65263027--65263198
46
3.8
45
92
1
265
34
8
31
25
1.85
65265660--65266037
47
8.0
47
91
1
580
33
11
28
25
1.92
65266018--65266195
46
3.9
46
90
0
257
36
8
29
25
1.85
65270500--65270545
21
2.2
21
88
0
65
19
30
28
21
1.98
65279001--65279253
103
2.4
104
92
0
418
29
29
21
19
1.98
65286020--65286284
103
2.6
104
90
3
417
29
29
20
19
1.97
65293640--65293970
178
1.9
178
94
0
590
16
18
21
43
1.88
65296055--65296092
19
2.0
19
85
10
51
68
0
10
21
1.19
65299513--65299573
30
2.0
30
90
0
95
37
8
24
29
1.84
65307934--65307959
12
2.2
12
100
0
52
26
34
23
15
1.94
65323430--65323617
49
3.8
49
82
2
250
27
18
25
28
1.98
65323425--65323612
100
1.9
100
92
0
313
26
19
25
28
1.99
65325762--65325933
46
3.7
46
75
14
174
29
27
20
22
1.99
65325767--65325937
93
1.8
93
90
5
274
28
28
21
22
1.99
65334633--65334756
40
3.1
40
81
4
160
23
22
28
25
1.99
65338473--65338644
46
3.7
45
78
10
195
27
27
22
22
1.99
65338478--65338648
93
1.8
93
93
0
297
27
28
22
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65339376--65339406
11
2.7
12
95
5
55
58
3
0
38
1.15
65357785--65357831
24
2.0
24
91
0
76
34
29
12
23
1.92
65357795--65357857
24
2.6
24
89
0
90
31
34
14
19
1.91
65365752--65365797
23
2.0
23
86
4
65
32
30
13
23
1.93
65365762--65365823
23
2.6
24
84
5
81
30
35
14
19
1.92
65371756--65371867
42
2.7
42
88
5
172
30
25
19
24
1.98
65374145--65374191
19
2.3
20
82
10
60
36
0
14
48
1.44
65375750--65375865
44
2.6
45
82
6
137
21
30
21
26
1.98
65386888--65386955
19
3.7
19
92
7
122
36
14
11
36
1.83
65386888--65386955
36
2.0
34
91
8
111
36
14
11
36
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311