Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  53  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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224
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1.99
15257196--15257453
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200
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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90
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56
5
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8
78
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15382320--15382366
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7.5
6
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15
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4
14
2
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2.8
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22
28
25
2.00
15409948--15410103
28
5.6
28
84
6
181
30
19
26
23
1.98
15409946--15410102
84
1.9
84
89
0
242
29
19
27
23
1.98
15409946--15410138
84
2.3
84
82
5
230
29
19
27
24
1.98
15417335--15417443
49
2.3
48
80
6
123
24
26
21
27
1.99
15417363--15417547
49
3.6
49
74
19
153
22
27
21
28
1.99
15417475--15417639
89
1.8
90
84
6
228
22
29
18
29
1.97
15419770--15419810
6
6.5
6
83
10
55
14
21
0
63
1.30
15424801--15424857
28
2.0
28
96
0
105
8
28
15
47
1.75
15424900--15424927
12
2.3
12
100
0
56
14
0
0
85
0.59
15428178--15428202
13
1.9
13
100
0
50
88
0
12
0
0.53
15434795--15434948
49
3.1
48
75
7
150
27
14
25
33
1.94
15435763--15436820
352
3.0
352
98
0
2062
39
23
6
30
1.80
15438973--15439018
19
2.3
20
81
7
58
19
17
10
52
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15439610--15439692
28
3.0
28
82
3
96
30
15
15
38
1.89
15440250--15440354
34
3.1
34
94
0
192
38
19
1
40
1.62
15440391--15440427
6
6.5
6
93
3
51
32
18
0
48
1.49
15442281--15442344
33
1.9
33
81
12
78
31
4
14
50
1.63
15442373--15442446
18
4.2
18
79
6
71
63
0
5
31
1.17
15442815--15442884
31
2.3
31
87
2
97
35
11
2
50
1.53
15442834--15442899
31
2.1
31
97
0
123
28
10
4
56
1.53
15442911--15442982
19
3.9
18
78
10
65
37
4
0
58
1.18
15442895--15442962
36
1.9
35
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5
102
30
7
0
61
1.23
15442904--15442982
10
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10
72
19
53
36
5
0
58
1.20
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9
7.1
9
76
17
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35
2
0
61
1.12
15442910--15442989
38
2.2
35
80
10
88
38
3
0
57
1.17
15444118--15444161
21
2.0
23
83
16
58
29
2
11
56
1.46
15444674--15444715
18
2.3
18
76
8
50
33
0
0
66
0.92
15448919--15448950
5
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5
100
0
64
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0
18
0
0.70
15452842--15452963
50
2.5
48
84
5
149
27
22
14
34
1.94
15458072--15458249
27
6.6
27
85
3
133
29
28
14
26
1.95
15458072--15458248
54
3.3
54
83
5
214
29
28
14
26
1.95
15458093--15458248
81
1.9
82
88
3
235
29
28
14
26
1.95
15480785--15480973
72
2.5
71
84
7
200
19
16
31
31
1.95
15494290--15494336
22
2.3
19
85
14
58
44
2
0
53
1.12
15494292--15494333
16
2.7
15
79
20
50
45
2
0
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15497108--15497136
5
5.8
5
100
0
58
82
0
17
0
0.66
15497240--15497314
36
2.1
36
97
0
141
28
18
10
42
1.83
15498909--15498990
39
2.1
39
97
0
155
30
10
17
41
1.83
15500475--15500729
55
4.8
53
80
9
247
21
25
17
36
1.95
15500522--15500722
108
1.8
110
87
4
300
22
25
17
34
1.96
15503343--15503367
9
2.8
9
100
0
50
12
0
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2.0
38
100
0
152
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0
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2.3
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82
7
214
25
27
22
24
2.00
15517976--15518179
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5.1
40
80
8
220
25
27
22
25
1.99
15542300--15542335
18
2.0
18
89
10
56
58
19
0
22
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311