Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  284  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
455
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22
26
1.94
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1.9
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0
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2.0
46
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0
130
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22
22
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0
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2.5
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22
11
14
50
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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27
100
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17
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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1.98
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1.98
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1.99
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
93023207--93023256
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27
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21
18
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104
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3
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32
1.30
93048165--93048229
19
3.4
19
75
12
60
69
6
3
21
1.25
93049798--93049837
19
2.1
19
85
4
53
30
10
10
50
1.69
93050819--93050893
31
2.5
31
75
14
75
45
2
4
48
1.35
93051006--93051033
12
2.3
12
100
0
56
39
0
0
60
0.97
93052877--93052937
29
2.1
29
96
0
113
31
0
22
45
1.53
93052877--93052925
16
3.2
16
69
16
50
32
0
20
46
1.51
93053239--93053293
21
2.6
21
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0
65
25
23
27
23
2.00
93056191--93056390
52
3.9
52
79
12
195
25
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28
30
1.97
93056201--93056370
53
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48
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116
26
17
26
29
1.98
93057142--93057196
20
2.8
20
91
0
92
18
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32
16
1.93
93057546--93057593
3
16.0
3
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8
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66
2
31
0
1.03
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48
10.0
48
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0
796
36
6
24
31
1.82
93061968--93062077
37
3.0
37
91
0
175
24
18
30
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93063523--93063563
3
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3
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5
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0
34
0
65
0.93
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2
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2
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0
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0
0
48
1.00
93066142--93066173
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2.0
16
100
0
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12
18
25
1.85
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17
2.8
17
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15
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80
4
0
15
0.86
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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33
0
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1.29
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2.0
44
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0
102
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4
6
40
1.51
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0
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0
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0
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100
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0
0
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66
0.92
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2.9
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107
36
13
5
44
1.68
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2.8
20
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5
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46
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1.53
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19
1.9
19
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0
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54
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0
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25
2.3
25
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52
11
1
33
1.48
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3
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3
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12
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69
1
1
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1.07
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18
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19
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1
1
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1.06
93118714--93118778
23
2.7
25
68
20
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9
4
33
1.54
93118640--93118908
128
2.1
126
79
9
287
59
5
5
29
1.43
93119089--93119148
20
3.0
20
79
13
61
56
5
1
36
1.31
93119101--93119163
32
2.0
32
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6
83
58
4
1
34
1.29
93119103--93119158
26
2.3
23
84
9
67
58
3
1
35
1.26
93119103--93119155
23
2.3
23
83
6
63
58
3
1
35
1.27
93119253--93119309
12
4.7
13
83
12
77
54
0
7
38
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93119255--93119309
24
2.3
24
96
0
101
54
0
7
38
1.28
93119255--93119317
24
2.7
22
90
7
74
53
0
6
39
1.26
93120814--93121472
89
7.6
88
74
13
424
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19
16
27
1.93
93121115--93121454
181
1.9
177
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492
36
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28
1.93
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343
1.8
333
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862
35
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16
28
1.94
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2.2
72
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2
249
33
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16
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21
2.0
21
100
0
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22
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72
2
2
22
1.05
93133867--93133931
23
2.7
25
70
20
66
53
9
3
33
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311