Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  210  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72427737--72427770
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0
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58
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116
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1.91
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87
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1.43
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6
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2.1
31
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0
85
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13
12
43
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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23
2
23
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72480358--72480387
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2.0
15
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72491826--72491985
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2.5
64
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0
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33
11
10
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21
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19
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19
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1.97
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175
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20
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1.97
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4.3
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454
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22
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1.99
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2.0
164
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22
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72501313--72501355
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9
86
13
61
0
13
0
86
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17
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29
1.97
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3.9
36
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16
129
30
16
24
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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1.21
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3.3
35
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12
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2
33
1.27
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3.1
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1.17
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2
3
29
1.22
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1.17
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22
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1
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2.8
108
95
3
533
52
3
0
42
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72537923--72537965
20
2.1
21
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4
61
58
4
0
37
1.19
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19
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5.1
27
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12
22
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13
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61
0
14
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72544912--72545242
48
7.0
44
71
19
172
61
0
13
24
1.37
72545108--72545241
22
5.8
22
68
20
60
62
0
10
26
1.27
72545130--72545249
26
5.0
23
70
18
66
61
0
12
25
1.31
72545019--72545242
93
2.4
88
82
12
256
62
0
12
25
1.36
72545207--72545300
16
5.8
17
77
14
67
61
1
13
23
1.38
72545202--72545264
32
1.9
33
87
3
92
63
0
9
26
1.25
72545182--72545296
22
5.0
22
75
16
83
60
0
13
25
1.38
72545234--72545300
5
12.6
5
81
9
62
61
1
16
20
1.42
72545228--72545308
27
2.9
28
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5
85
60
1
13
24
1.41
72545234--72545339
22
4.9
21
73
7
70
57
0
14
27
1.43
72545234--72545339
11
9.8
11
71
11
60
57
0
14
27
1.43
72545774--72545884
18
5.7
20
73
20
83
63
0
8
27
1.28
72545826--72545893
34
2.0
35
82
8
86
58
0
11
29
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72545873--72545924
5
9.6
5
76
15
50
61
1
15
21
1.43
72545867--72545908
16
2.6
16
88
0
57
59
0
14
26
1.35
72566253--72566283
6
5.2
6
100
0
62
0
32
51
16
1.44
72567401--72567434
10
3.3
10
88
8
50
70
0
0
29
0.87
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20
1.9
20
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5
60
66
0
0
33
0.92
72567455--72567480
9
2.9
9
100
0
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46
0
0
53
1.00
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25
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3
78
33
21
25
20
1.97
72569218--72569278
26
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25
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24
16
1.93
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39
2.2
39
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0
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1.91
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2.2
20
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43
20
0
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0
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0
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0.93
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2.0
30
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45
8
5
40
1.56
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2.0
64
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0
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45
10
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34
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2
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0
70
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0
0
45
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24
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0
100
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1.75
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30
2.0
30
90
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0
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1.53
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16
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17
22
20
40
1.92
72607281--72607370
22
4.0
22
80
9
101
17
22
18
41
1.91
72607285--72607381
45
2.2
45
84
0
122
20
23
17
38
1.93
72614155--72614195
9
4.6
9
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0
64
26
9
19
43
1.82
72614821--72614891
26
2.7
26
78
6
63
12
9
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76
1.09
72614819--72614892
31
2.4
30
82
8
94
12
9
1
77
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72614914--72614984
9
7.9
9
73
10
56
12
4
4
78
1.03
72614921--72614962
16
2.5
17
80
11
50
11
7
4
76
1.15
72614930--72614975
24
1.9
24
82
8
58
10
4
6
78
1.08
72614906--72614984
34
2.4
32
79
10
79
13
5
3
77
1.08
72615030--72615172
37
4.0
35
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11
121
39
1
2
55
1.23
72615230--72615271
20
2.2
19
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57
21
2
2
73
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2.3
18
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0
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36
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18
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24
1
1
71
1.06
72615497--72615608
37
3.2
36
79
7
131
34
0
2
61
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311