Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  31  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.58
Indices
Period
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Copy
Number
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Size
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Indels
Score
A
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Entropy
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2.3
23
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2.3
25
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30
6
3
59
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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2.0
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12
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7
23
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
88
2
380
31
19
19
29
1.97
9030929--9031262
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9031693--9032026
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9030685--9035266
764
6.0
764
100
0
9164
32
18
14
35
1.91
9032457--9032790
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9033221--9033554
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9033985--9034318
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9034749--9035082
131
2.6
129
80
7
352
27
17
18
35
1.94
9036577--9036616
17
2.4
17
86
0
53
32
2
5
60
1.32
9036691--9036747
27
2.1
28
77
9
64
38
7
0
54
1.28
9036701--9036756
27
2.1
27
83
3
69
39
3
0
57
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9036778--9036831
27
2.0
26
89
3
81
27
3
9
59
1.45
9046107--9046184
40
2.0
40
97
0
147
52
6
7
33
1.55
9046304--9046344
19
2.1
20
86
4
57
31
9
2
56
1.45
9046879--9046917
19
2.0
20
90
5
62
33
7
5
53
1.51
9047814--9047890
38
2.0
38
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0
100
31
20
23
24
1.98
9047882--9047993
29
3.9
29
85
0
143
26
18
21
33
1.97
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28
2.2
28
80
11
72
27
22
14
34
1.94
9050024--9050067
20
2.1
21
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4
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25
13
0
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1.32
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20
2.9
21
76
14
54
55
5
3
36
1.38
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19
1.9
19
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0
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35
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10
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1.89
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2.0
56
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7
172
54
0
8
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1.36
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19
2.8
19
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0
97
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20
1.94
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2.0
84
94
0
293
43
5
20
30
1.74
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29
2.0
29
83
6
73
41
13
20
24
1.89
9067638--9067968
164
2.0
164
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1
421
41
14
20
23
1.89
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26
1.9
26
83
0
64
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16
0
38
1.47
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11
4.0
11
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15
58
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0
0
36
0.94
9069412--9069458
25
1.9
24
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4
76
63
0
0
36
0.94
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21
2.2
22
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3
78
21
19
38
21
1.94
9080328--9080398
31
2.3
31
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7
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54
19
4
21
1.60
9080432--9080471
21
1.9
21
94
0
71
27
17
25
30
1.97
9082141--9082218
33
2.4
33
79
12
88
26
25
16
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9082162--9082354
104
1.9
101
86
5
271
27
26
15
30
1.96
9083853--9083893
21
2.0
21
90
0
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31
17
21
1.96
9086211--9086336
39
3.2
39
88
0
171
26
31
20
21
1.98
9086180--9086329
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1.9
78
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5
178
26
30
20
22
1.98
9094241--9094392
39
3.9
39
94
0
250
26
29
21
23
1.99
9096857--9096924
23
3.3
23
64
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62
33
2
16
47
1.62
9096690--9096943
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39
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1
314
30
5
20
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1.74
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3
71
7
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4
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1.31
9098442--9098506
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2.0
33
87
0
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30
1
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1.29
9098472--9098515
21
2.0
22
86
4
63
25
4
2
68
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311