Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  48  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13712247--13712279
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0
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31
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13713576--13713630
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2.6
21
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30
18
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2.3
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3.0
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2.0
100
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0
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21
39
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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13783065--13783102
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2.1
18
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2.2
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23
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2.0
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22
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0
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66
0
0
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1.9
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68
72
4
23
0
1.04
13816802--13816870
6
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26
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24
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2.3
15
89
0
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38
8
17
35
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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26
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1.91
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16
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23
37
1.94
13846374--13846488
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2.1
54
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160
16
22
23
37
1.94
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2.0
22
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2
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1.61
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1.9
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19
0
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26
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19
0
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0
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1.13
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0
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0
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0
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19
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22
14
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1.90
13894206--13894480
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2.9
92
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21
22
14
41
1.89
13894201--13894480
138
2.0
140
88
4
413
22
22
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13896612--13896657
16
2.8
17
83
6
58
13
13
0
73
1.09
13896608--13896645
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3.7
10
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13
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5
15
0
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2.0
20
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5.2
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27
15
32
24
1.96
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93
2.4
93
78
9
224
28
16
32
23
1.95
13925656--13926303
132
4.9
131
78
4
520
34
17
18
29
1.94
13926838--13926876
20
2.0
20
85
10
53
61
0
7
30
1.24
13927214--13927239
12
2.2
12
100
0
52
42
0
7
50
1.31
13929408--13929655
132
1.9
132
84
5
340
28
23
19
29
1.98
13941186--13941830
132
5.0
131
74
10
442
33
18
18
28
1.95
13942360--13942398
20
2.0
20
85
10
53
61
0
7
30
1.24
13942739--13942764
12
2.2
12
100
0
52
42
0
7
50
1.31
13948442--13948484
21
2.0
21
100
0
86
37
9
4
48
1.56
13949648--13949730
42
2.0
42
87
0
121
28
19
18
33
1.95
13955539--13955588
22
2.3
22
78
0
55
36
4
4
56
1.37
13963030--13963119
44
2.0
44
80
4
101
32
21
20
26
1.97
13964274--13964320
21
2.1
22
81
14
53
12
4
8
74
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13964495--13964544
18
2.7
19
90
6
77
56
4
0
40
1.18
13964471--13964552
42
1.9
43
85
7
114
57
3
0
39
1.16
13964630--13964701
33
2.2
32
85
11
94
52
5
0
41
1.24
13970557--13970621
21
3.1
21
75
6
69
36
24
16
21
1.94
13980187--13980290
52
2.0
52
94
0
181
31
9
20
38
1.85
13980935--13981030
48
2.0
48
97
0
183
26
16
17
39
1.91
13981600--13981659
3
20.3
3
96
3
113
31
0
0
68
0.90
13983433--13983476
3
14.7
3
95
0
79
65
2
0
31
1.05
13985795--13986299
131
3.8
131
76
6
362
34
18
20
27
1.95
13987998--13988043
23
1.9
25
82
8
60
52
8
4
34
1.52
13990475--13990539
34
2.0
34
81
6
80
32
26
15
26
1.95
13992384--13992467
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
13996020--13996066
20
2.3
20
100
0
94
42
14
12
29
1.83
13999989--14000062
17
4.6
16
70
12
55
18
2
2
75
1.04
13999990--14000040
27
1.9
25
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11
66
21
1
1
74
1.02
13999984--14000045
33
1.9
32
83
9
81
22
3
1
72
1.08
14000027--14000060
6
5.3
6
86
13
50
14
2
2
79
0.97
14000022--14000060
20
2.0
20
94
0
69
12
2
5
79
1.00
14000143--14000191
20
2.3
20
86
6
62
14
4
2
79
0.97
14003974--14004032
30
2.0
30
83
6
75
35
5
11
47
1.62
14006234--14006305
35
2.1
35
81
0
81
22
15
26
36
1.93
14015302--14015350
25
2.0
25
91
0
80
32
18
20
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14026918--14027029
47
2.4
47
82
5
138
36
22
15
25
1.93
14027783--14027813
15
2.0
16
93
6
55
6
19
0
74
1.03
14030280--14030414
42
3.2
43
76
7
125
41
16
23
18
1.90
14030385--14030427
21
2.1
20
83
12
52
41
16
16
25
1.88
14033047--14033102
19
3.1
18
82
12
53
57
8
0
33
1.30
14033829--14033877
20
2.4
22
83
13
68
63
0
0
36
0.95
14033831--14033876
21
2.2
21
88
7
67
67
0
0
32
0.91
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2.0
40
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0
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2.3
15
89
0
50
58
0
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32
1.29
14043058--14043092
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311