Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  13  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
19
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2
2
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1.30
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0
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20
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2
42
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.16
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1.35
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14
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15
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1.18
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0
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24
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2.0
22
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59
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2
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60
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10
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25
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75
4
2
18
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2.9
16
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4
2
18
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2.8
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4
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1.17
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2.5
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8
8
1.21
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3.1
22
71
20
56
67
1
30
1
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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3.8
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11
59
72
0
1
26
0.93
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13
4.5
13
72
16
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69
3
1
25
1.13
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450
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120
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150
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7
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1.53
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10
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0
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20
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6
6
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29
21
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1.98
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27
29
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1.99
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1.99
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19
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12
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17
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1.76
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2.0
26
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20
7
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1.48
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2.2
44
86
3
131
45
9
10
34
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3822380--3822499
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3.0
40
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0
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12
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21
27
29
1.99
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1.8
93
93
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21
28
28
1.98
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22
2.5
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11
64
52
3
0
43
1.18
3834886--3834941
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3
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10
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1
0
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22
21
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93
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21
27
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26
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28
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28
100
0
110
40
7
10
41
1.68
3852221--3852250
15
2.0
15
93
0
51
13
0
3
83
0.77
3869076--3869113
20
1.9
20
88
0
58
71
15
0
13
1.16
3869162--3869202
21
2.0
21
85
9
57
75
4
12
7
1.16
3870451--3870487
18
2.0
19
85
15
51
62
5
2
29
1.31
3870633--3870683
26
2.0
25
88
7
77
27
17
9
45
1.80
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31
2.0
32
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3
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9
1
34
1.43
3877086--3877127
21
1.9
23
85
9
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26
4
4
64
1.33
3887174--3887514
171
2.0
171
93
0
583
30
19
17
33
1.94
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4
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4
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10
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82
0
17
0
0.66
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15
2.4
15
100
0
72
86
0
13
0
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3889711--3889752
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2.3
18
91
4
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83
0
16
0
0.65
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19
2.7
21
73
18
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63
3
1
30
1.22
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6
4.2
6
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0
50
52
0
0
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1.00
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3.7
11
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0
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19
14
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0
0
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0.90
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2.6
21
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0
101
14
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18
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1.87
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2.0
15
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0
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3
3
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1.23
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0
0
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0
0
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1.00
3909656--3909710
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0
0
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1.00
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4
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16
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0
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5
10
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3.9
26
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0
168
37
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5
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1.80
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28
2.0
28
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0
85
39
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10
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1.87
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2.0
20
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1.15
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7
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20
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1.95
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185
1.9
183
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1
457
30
20
16
32
1.95
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133
3.2
133
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8
402
29
20
16
33
1.94
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140
3.2
138
77
8
458
29
19
16
34
1.94
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44
8.6
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11
206
28
18
17
35
1.94
3929188--3929276
44
2.0
44
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4
108
30
22
15
31
1.95
3941163--3941210
20
2.4
20
82
0
60
72
2
4
20
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3943591--3943641
22
2.3
22
89
0
84
76
1
9
11
1.10
3943603--3943664
32
2.0
31
84
9
81
75
4
9
9
1.17
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13
2.8
12
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11
11
0
77
1.00
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26
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5
4
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1.9
24
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0
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30
4
10
54
1.55
3945792--3946059
26
10.4
24
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12
171
30
4
4
61
1.35
3945792--3946060
52
5.2
52
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4
4
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20
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2
1
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2
2
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9
3.0
10
90
10
51
10
0
0
89
0.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311