Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  153  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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178
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28
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16
28
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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28
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27
1.97
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12
100
0
50
36
40
16
8
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52240561--52240593
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3.0
11
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0
49
1.32
52257069--52257157
23
4.0
23
71
9
69
43
5
1
49
1.33
52257754--52257805
16
3.4
15
74
10
52
48
0
0
51
1.00
52257764--52257811
16
3.0
16
75
6
53
52
0
0
47
1.00
52272033--52272077
24
2.0
23
86
8
65
28
22
0
48
1.50
52272329--52272371
15
2.9
15
79
6
52
62
4
0
32
1.15
52275154--52275232
35
2.3
35
85
10
101
24
2
25
48
1.64
52275400--52275777
126
3.0
126
90
0
569
37
17
15
29
1.90
52278812--52278887
25
2.8
27
70
21
70
50
5
0
44
1.24
52279896--52279929
7
4.9
7
86
13
52
58
11
0
29
1.33
52280859--52280948
25
3.4
25
70
15
74
61
4
3
31
1.32
52280861--52280981
54
2.2
54
95
2
217
61
4
2
31
1.27
52280859--52280949
26
3.5
25
69
19
69
61
4
3
30
1.31
52280878--52280959
25
3.2
25
67
20
69
62
3
3
30
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52281136--52281185
21
2.4
21
86
0
64
40
2
24
34
1.66
52286662--52286713
22
2.3
22
86
6
68
34
5
1
57
1.33
52297102--52297272
46
3.7
46
81
12
176
24
30
19
25
1.98
52309225--52309272
22
2.2
22
84
0
60
64
4
12
18
1.43
52312507--52312612
25
4.3
24
71
16
83
26
20
18
33
1.96
52312507--52312588
25
3.3
25
82
1
103
26
20
19
32
1.97
52314225--52314359
40
3.4
38
87
8
198
30
24
21
23
1.99
52315174--52315205
2
16.0
2
100
0
64
50
50
0
0
1.00
52322328--52322433
40
2.7
38
84
9
115
30
25
22
21
1.99
52322352--52322435
40
2.1
40
95
0
150
30
23
21
23
1.99
52325079--52325116
14
2.6
15
79
8
51
42
7
10
39
1.69
52327326--52327379
18
3.3
18
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28
57
22
7
48
22
1.75
52327324--52327419
30
3.2
30
91
2
149
18
5
48
27
1.69
52328074--52328659
87
6.6
89
79
10
460
37
18
16
28
1.92
52328123--52328659
178
3.0
176
80
10
472
37
17
16
27
1.92
52328464--52328496
14
2.4
14
94
0
57
63
6
12
18
1.48
52328159--52328659
265
1.9
262
82
7
636
36
17
16
28
1.92
52328572--52329006
147
3.0
146
94
0
753
32
20
16
30
1.95
52329195--52329239
13
3.4
13
81
6
63
68
4
11
15
1.34
52329023--52329311
100
2.9
100
86
6
381
39
17
17
24
1.92
52329222--52329458
73
3.2
73
92
1
377
33
21
16
28
1.95
52329122--52329979
250
3.4
248
76
16
779
35
19
16
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52329617--52329650
13
2.5
14
85
9
52
55
2
20
20
1.56
52329791--52330113
75
4.1
76
72
16
266
33
19
15
32
1.93
52329457--52330205
162
4.6
160
76
11
626
34
19
16
28
1.94
52330111--52330145
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
52337690--52337743
18
3.3
18
66
28
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22
7
48
22
1.75
52337685--52337783
30
3.3
30
91
0
162
18
6
48
27
1.71
52340132--52340169
19
2.0
19
85
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51
71
5
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2.3
27
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6
1
57
1.33
52341652--52341691
11
3.5
11
86
3
53
50
7
2
40
1.44
52348650--52348693
19
2.2
20
88
4
63
65
2
2
29
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311