Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  273  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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3
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47
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Period
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Number
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A
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(0-2)
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17
84
12
80
81
1
17
0
0.77
90348337--90348372
7
4.9
7
87
12
54
83
0
16
0
0.65
90348524--90348561
16
2.3
17
86
4
51
23
0
2
73
0.95
90348713--90349233
17
29.8
18
70
13
256
34
11
10
42
1.77
90348724--90348777
16
3.2
16
75
14
56
35
14
9
40
1.78
90348770--90348945
74
2.4
75
80
4
178
38
12
8
40
1.74
90348734--90349086
36
9.8
37
70
16
124
34
12
10
41
1.78
90348848--90348955
55
1.9
56
83
7
139
38
12
11
37
1.79
90349008--90349190
97
1.9
95
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4
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35
8
10
45
1.69
90349252--90349289
16
2.3
17
81
4
51
36
15
10
36
1.82
90351663--90351764
50
2.0
50
100
0
204
50
5
7
36
1.56
90359792--90360025
47
4.9
47
79
9
220
32
25
15
26
1.96
90359827--90359979
53
3.0
52
78
12
174
34
23
15
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90359827--90360014
100
1.9
100
84
2
252
33
23
15
27
1.95
90360585--90360634
13
3.4
15
78
13
50
48
10
2
40
1.48
90361931--90361997
25
2.7
24
68
22
66
22
13
14
49
1.79
90366855--90366953
37
2.6
37
91
1
162
31
24
16
28
1.96
90371837--90371893
30
1.9
30
85
7
80
28
36
24
10
1.88
90378326--90378433
33
3.4
32
69
20
93
36
0
12
51
1.39
90378724--90378792
27
2.6
27
90
0
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26
26
27
20
1.99
90378819--90378878
27
2.2
27
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8
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66
3
0
30
1.07
90383094--90383156
26
2.4
27
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7
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6
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34
1.41
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2.2
19
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4
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63
2
2
31
1.20
90387424--90387632
52
4.1
51
85
9
275
35
13
22
27
1.93
90387410--90387632
98
2.3
97
80
9
231
34
13
22
28
1.93
90387528--90387743
37
5.3
44
87
9
199
37
14
21
26
1.92
90387596--90387741
37
4.0
37
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1
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36
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24
1.94
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13
2.8
14
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27
25
0
47
1.52
90389541--90389581
18
2.2
19
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12
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29
24
0
46
1.53
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21
2.8
23
80
14
85
34
26
24
14
1.94
90389743--90389827
21
3.9
23
75
10
70
37
23
21
17
1.94
90390200--90390257
15
3.8
15
88
2
89
51
12
0
36
1.39
90390203--90390261
30
2.0
28
93
6
100
55
11
0
32
1.36
90391218--90391245
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2.2
13
100
0
56
0
14
7
78
0.95
90393801--90393918
33
3.6
31
76
13
103
27
11
43
16
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90395671--90395734
22
2.9
22
77
13
60
62
4
0
32
1.16
90395708--90395739
16
2.1
16
94
5
57
56
6
0
37
1.25
90395797--90396240
115
3.9
113
91
3
671
51
15
0
31
1.50
90395797--90396240
228
1.9
226
89
4
687
51
15
0
31
1.50
90396509--90396551
22
2.0
22
90
0
68
2
41
0
55
1.12
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17
2.9
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2
4
24
1.17
90399427--90399492
16
4.2
16
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11
73
59
0
1
39
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0
0
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2.2
16
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0
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57
0
0
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0.99
90403808--90403854
13
3.2
15
73
14
53
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311