Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  28  of  311  ( 37258 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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119
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0
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19
18
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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25
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0
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0
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8067235--8067281
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2.7
26
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2
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19
0
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1.51
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10.5
6
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3
83
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3
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1.01
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1
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3
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22
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1
23
1.00
8102860--8102923
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13
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1
1
21
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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21
24
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1.99
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22
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1.9
18
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54
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2
16
1.21
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3.9
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85
4
216
25
14
26
32
1.95
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11
2.6
12
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53
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33
30
30
1.83
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3
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7.7
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7.3
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9
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16
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0
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1.45
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2.3
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15
19
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25
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19
118
35
7
4
52
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8194152--8194282
52
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24
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1.9
18
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2
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1.21
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2.3
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51
20
0
27
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135
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18
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17
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0
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0
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8233362--8233425
33
2.0
32
84
3
83
20
21
20
37
1.94
8235580--8235619
21
1.9
21
89
0
62
25
17
30
27
1.97
8235712--8235751
6
6.8
6
82
5
55
15
5
0
80
0.88
8236721--8236766
4
11.5
4
95
0
83
50
21
0
28
1.49
8240745--8240769
12
2.1
12
100
0
50
16
0
0
84
0.63
8242972--8243001
11
2.7
11
89
0
51
10
50
10
30
1.69
8243065--8243116
5
9.6
5
78
14
50
26
0
0
73
0.84
8243069--8243114
13
3.4
13
82
17
58
26
0
0
73
0.83
8243065--8243116
16
3.2
16
86
2
68
26
0
0
73
0.84
8247053--8247083
8
3.9
8
100
0
62
12
9
0
77
0.99
8247294--8247336
9
4.6
9
80
11
50
11
4
9
74
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8248450--8248482
17
1.9
17
93
0
57
21
30
9
39
1.84
8253510--8253549
15
2.6
16
84
7
57
30
0
0
70
0.88
8253543--8253584
14
2.8
15
92
7
68
28
4
2
64
1.26
8255183--8255264
6
13.3
6
76
17
62
15
2
3
78
1.01
8255183--8255243
5
11.6
5
78
13
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14
3
3
78
1.00
8255230--8255310
25
3.3
25
77
14
73
20
3
3
71
1.17
8257259--8257462
102
2.0
102
97
1
383
31
23
22
22
1.98
8258713--8258867
43
3.6
43
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5
127
30
24
16
27
1.97
8262993--8263029
4
9.2
4
100
0
74
24
0
0
75
0.80
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13
2.0
13
100
0
52
7
30
38
23
1.83
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24
2.3
24
96
0
101
23
40
21
14
1.90
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12
2.5
12
100
0
60
50
0
13
36
1.42
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48
2.1
48
96
1
180
45
11
13
29
1.78
8277811--8277855
23
2.0
23
86
0
63
44
2
6
46
1.42
8277948--8278010
20
3.2
20
73
8
65
17
19
12
50
1.77
8278466--8278536
20
3.3
20
75
21
63
16
8
11
63
1.51
8283853--8283886
17
2.0
17
100
0
68
52
17
0
29
1.45
8293947--8294013
17
3.9
17
78
3
62
61
0
1
37
1.05
8294250--8294283
13
2.7
13
86
4
52
29
0
2
67
1.05
8294311--8294366
25
2.4
24
85
14
73
58
5
1
33
1.31
8294890--8294956
9
7.6
8
73
17
53
25
4
0
70
1.06
8294940--8295033
36
2.6
36
75
11
95
32
3
1
62
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8295048--8295212
90
1.8
91
86
3
244
32
9
20
36
1.85
8295050--8295248
90
2.2
89
82
7
231
31
9
21
38
1.84
8296111--8296208
40
2.5
40
86
0
142
38
22
8
30
1.83
8303958--8304133
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
8303955--8304126
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
8311533--8311661
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
8314936--8315156
79
2.8
79
88
0
327
31
23
14
30
1.94
8315251--8315388
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3.5
40
84
0
150
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21
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1.90
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119
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0
438
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11
3.2
10
88
12
50
70
0
0
29
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311