Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  233  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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22
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.2
14
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77
6
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3.5
20
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13
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1.93
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884
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23
6
32
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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60
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59
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160
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25
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78904823--78904882
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1.28
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1.95
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0
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0
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26
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78918842--78918905
5
12.4
5
82
11
76
76
0
3
20
0.92
78918842--78918914
15
4.9
15
80
12
71
75
0
2
21
0.93
78918842--78918905
21
3.1
21
86
6
87
76
0
3
20
0.92
78924449--78924529
41
2.0
41
90
7
128
56
2
14
25
1.51
78925107--78925154
21
2.3
21
100
0
96
41
0
22
35
1.54
78925283--78925332
10
5.0
10
81
13
59
68
0
8
24
1.16
78927983--78928033
19
2.6
21
84
9
63
9
9
15
64
1.48
78929468--78929509
22
1.9
22
100
0
84
21
19
21
38
1.94
78936346--78936444
40
2.5
39
76
14
112
41
7
12
39
1.70
78936322--78936469
20
7.3
20
66
12
61
39
6
12
41
1.68
78936526--78936600
20
3.8
19
77
7
69
41
6
13
38
1.70
78936575--78936776
20
10.1
20
71
5
95
41
6
12
39
1.70
78936804--78936845
20
2.1
20
86
8
59
45
2
16
35
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78936870--78937205
20
16.8
20
70
10
105
38
6
14
40
1.72
78936870--78936984
59
1.9
59
82
3
142
40
5
13
40
1.67
78937014--78937075
22
2.9
22
78
4
74
37
8
16
38
1.78
78936982--78937166
102
1.8
100
83
4
246
38
7
14
39
1.74
78936870--78937205
40
8.4
40
75
9
202
38
6
14
40
1.72
78937241--78937292
20
2.6
20
81
0
59
48
1
13
36
1.54
78937722--78937753
15
2.1
15
100
0
64
37
0
0
62
0.95
78938156--78938195
16
2.5
16
87
0
62
35
12
15
37
1.85
78941011--78941077
23
2.9
23
81
14
75
14
19
20
44
1.86
78951564--78951639
29
2.6
29
97
0
143
23
22
15
38
1.93
78968356--78968672
48
6.6
48
79
4
325
23
29
20
26
1.99
78968356--78968689
144
2.3
144
81
5
397
23
29
19
26
1.98
78976106--78976131
5
5.2
5
100
0
52
76
0
0
23
0.78
78980431--78980495
31
2.1
31
91
0
103
27
15
29
27
1.96
78982715--78982754
17
2.4
17
91
0
62
5
15
12
67
1.38
78994449--78994489
17
2.5
17
85
14
59
56
2
12
29
1.49
78996386--78996698
154
2.0
154
98
0
599
41
19
8
30
1.81
78997136--78997197
23
2.5
26
76
17
76
30
24
9
35
1.87
78997150--78997194
23
2.0
23
95
0
81
28
24
8
37
1.86
78997546--78997623
26
3.0
27
88
9
117
57
0
0
42
0.98
79000420--79000449
11
2.6
12
94
5
53
70
3
6
20
1.25
79000402--79000450
13
3.9
12
81
13
55
63
4
8
24
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79013351--79013455
48
2.2
48
83
11
126
31
34
13
20
1.91
79014898--79014982
37
2.3
37
85
4
109
30
18
24
25
1.98
79014986--79015183
48
4.1
48
87
2
290
27
19
25
27
1.99
79015136--79015226
42
2.2
42
86
4
121
26
17
25
30
1.97
79021285--79021389
6
17.0
6
72
16
81
48
15
18
18
1.81
79021281--79021355
19
4.0
19
81
10
100
46
14
21
17
1.83
79021285--79021367
37
2.2
37
91
0
130
46
15
19
18
1.83
79021288--79021389
31
2.9
36
77
16
115
49
14
17
18
1.80
79021508--79021567
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
79021535--79021676
67
2.1
67
86
5
194
30
22
28
18
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311