Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102106374

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   

This is table  43  of  311  ( 37258 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12181882--12182240
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4.6
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12208660--12208874
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2.2
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0
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18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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58
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3.0
27
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26
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16
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1
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0.96
12322900--12322991
38
2.3
39
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132
16
4
1
78
0.97
12322900--12323006
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25
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4
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100
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93
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2.1
27
93
0
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5.0
45
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21
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2.4
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24
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39
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.94
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34
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2
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1.30
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1.88
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3.6
24
80
0
100
23
18
25
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12430992--12431134
65
2.2
63
86
4
196
25
17
25
31
1.97
12440378--12440426
21
2.3
21
82
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55
22
4
2
71
1.13
12447499--12447562
32
2.0
32
96
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32
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0
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60
0
0
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2.5
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2.3
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27
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27
1.97
12461838--12461888
21
2.4
22
87
9
79
25
3
31
39
1.74
12469015--12469049
18
1.9
18
88
0
52
48
8
25
17
1.75
12469156--12469200
16
2.8
16
82
0
63
62
15
6
15
1.52
12473335--12473379
16
2.8
16
86
0
63
62
13
8
15
1.54
12473511--12473560
17
2.9
18
79
8
59
44
10
16
30
1.80
12473882--12473914
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
12474771--12474826
27
2.1
27
100
0
112
37
19
7
35
1.79
12477743--12477776
17
2.0
18
88
11
54
41
11
0
47
1.40
12500594--12500636
3
14.3
3
95
0
77
30
0
2
67
1.03
12502196--12502236
6
6.8
6
88
0
64
17
4
0
78
0.93
12503100--12503129
15
2.0
15
93
0
51
16
23
6
53
1.66
12506898--12507082
40
4.7
40
82
6
189
25
27
21
25
1.99
12506898--12507082
79
2.3
82
81
7
211
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12514870--12515053
79
2.3
81
80
8
209
25
27
22
25
2.00
12514870--12515053
39
4.7
40
79
9
207
25
27
22
25
2.00
12520730--12520788
29
2.0
29
83
6
75
37
11
5
45
1.63
12531828--12531872
19
2.4
19
88
7
65
22
22
13
42
1.88
12535615--12535771
53
3.0
53
90
0
233
22
12
8
56
1.62
12535624--12535714
27
3.4
26
70
25
82
21
16
6
54
1.64
12536208--12536387
46
3.9
45
86
4
218
35
16
21
26
1.95
12536611--12536730
46
2.6
46
80
3
127
32
21
15
30
1.95
12536396--12537002
44
13.6
45
67
8
202
30
20
17
30
1.96
12536364--12537580
268
4.5
268
75
7
1241
32
19
17
29
1.95
12536364--12537580
179
6.8
179
83
4
1230
32
19
17
29
1.95
12536757--12537592
356
2.3
358
87
2
1223
32
19
17
29
1.95
12539248--12539279
13
2.4
14
85
15
50
21
3
0
75
0.95
12544850--12544974
48
2.6
48
90
0
205
18
53
14
13
1.73
12544871--12544950
24
3.3
24
62
0
61
17
52
18
11
1.74
12544883--12544958
24
3.2
24
61
0
62
18
50
18
13
1.78
12549555--12549790
130
1.8
130
86
1
341
36
16
18
29
1.92
12551421--12551461
20
2.2
19
91
8
66
48
4
7
39
1.52
12553009--12553093
31
2.7
32
75
3
91
16
21
17
44
1.86
12556678--12556717
10
3.8
11
78
21
50
72
2
0
25
0.97
12557543--12557601
30
2.0
30
86
6
84
20
49
11
18
1.79
12559933--12559968
17
2.1
17
100
0
72
27
22
13
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12562574--12562616
22
2.0
22
86
9
61
39
0
2
58
1.11
12563007--12563056
7
7.4
7
73
8
50
30
0
4
66
1.10
12567308--12567666
179
2.0
179
86
2
497
33
10
7
48
1.65
12572201--12572241
19
2.1
19
86
9
55
63
0
4
31
1.15
12573787--12574202
44
9.5
44
66
14
221
20
22
22
33
1.97
12573766--12574688
88
10.5
88
86
2
1190
21
23
20
34
1.97
12573835--12574677
44
19.2
44
63
17
229
22
23
20
34
1.97
12586709--12586749
19
2.1
19
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9
55
63
0
4
31
1.15
12595755--12596354
45
13.6
45
66
14
232
28
25
17
28
1.97
12595718--12596495
132
5.9
132
92
0
1209
28
24
17
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311