Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  1  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9642--9667
13
2.0
13
100
0
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23
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2.0
26
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0
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1.95
18913--19062
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2.1
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3
230
30
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16
23
1.96
18913--19099
72
2.6
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8
227
31
31
17
20
1.96
19075--19125
26
2.0
26
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0
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29
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23
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1.90
18981--19202
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2.2
103
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31
31
18
18
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19527--19590
30
2.2
29
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10
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29
28
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1.82
19534--19590
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1.9
30
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3
80
29
24
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38
1.82
22291--22336
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2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
22298--22342
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
26823--26979
76
2.1
76
93
0
269
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13
15
35
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27106--27197
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2.0
47
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0
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1.9
105
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0
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12
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29520--29556
11
3.4
11
88
0
56
27
18
8
45
1.77
29809--29903
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2.0
48
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0
154
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9
27
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1.88
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4.0
18
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3
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34
16
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1.87
33497--33545
23
2.1
23
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4
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1.40
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1.9
25
82
0
60
56
2
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33
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33814--33910
48
2.0
48
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142
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2
6
37
1.37
33813--33910
24
4.0
25
77
9
112
54
2
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36
1.40
35048--35123
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3.2
23
74
7
71
0
15
9
75
1.05
35055--35123
22
3.1
21
75
17
68
0
15
8
75
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35056--35133
22
3.4
24
75
10
65
0
15
10
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1.07
36232--36390
27
5.9
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82
7
176
34
21
25
18
1.96
36250--36390
54
2.6
54
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2
239
34
22
24
17
1.96
36807--36843
8
4.6
8
93
0
56
5
24
21
48
1.71
38018--38125
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
38701--38744
18
2.4
18
84
0
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50
15
15
18
1.79
41708--41732
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100
0
50
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0
0
24
0.80
41705--41777
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2.5
31
78
13
82
60
4
0
35
1.16
43964--44016
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2.0
25
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11
20
1.60
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11
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0
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0
0
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1.9
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100
0
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27
13
0
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2.0
24
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36
2
0
61
1.08
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2.1
41
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2
122
22
1
9
66
1.27
47657--47819
3
53.3
3
68
15
66
31
8
1
58
1.39
47657--47718
14
4.3
15
80
10
76
35
6
0
58
1.24
47696--47738
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2.5
17
80
0
50
34
6
0
58
1.25
47710--47785
23
3.3
22
72
17
57
30
7
1
60
1.33
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10
5.4
10
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12
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35
1
1
60
1.17
47902--47947
7
6.7
7
83
11
60
39
0
2
58
1.10
47900--47947
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3.5
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86
8
69
37
0
2
60
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3
14.3
3
87
0
59
27
0
4
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1.10
48039--48080
15
2.8
15
92
0
66
26
0
4
69
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
48038--48080
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18
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0
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0
4
67
1.10
48039--48086
15
3.2
15
82
5
62
27
0
4
68
1.07
49610--49728
47
2.5
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5
123
37
26
10
25
1.89
49671--49810
53
2.9
47
72
12
127
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25
12
25
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12
2.2
12
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0
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25
0
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2.3
16
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22
16
25
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1.94
54126--54206
40
2.0
40
100
0
162
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12
18
34
1.88
60992--61046
21
2.6
21
88
0
83
21
7
40
30
1.81
61158--61213
18
3.1
18
72
23
55
55
3
1
39
1.28
69812--69882
27
2.6
27
90
2
106
40
14
28
16
1.87
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5
10.8
5
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12
62
43
0
1
55
1.10
71191--71248
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
71193--71248
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
72821--72930
38
2.8
40
72
5
98
23
19
27
30
1.98
73076--73116
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2.2
19
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12
59
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0
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0
0
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83147--83238
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100
0
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25
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163
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20
25
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1.98
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6
178
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25
23
1.97
102294--102352
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102538--102583
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0
6
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1.24
102608--102655
23
2.1
22
81
11
53
66
4
4
25
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102721--102791
11
6.3
11
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18
65
59
9
0
30
1.30
102732--102792
21
2.7
22
76
16
61
59
11
0
29
1.33
102752--102802
21
2.4
22
93
3
86
58
7
0
33
1.27
104079--104103
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1.9
13
100
0
50
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12
32
32
1.91
104485--104860
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22
34
1.96
104484--104899
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14
167
20
22
22
34
1.97
104500--104817
131
2.4
132
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6
373
21
21
22
34
1.97
104653--105043
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87
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493
19
24
21
34
1.96
104653--105043
173
2.3
173
94
0
674
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24
21
34
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3.0
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20
54
64
7
4
23
1.38
123498--123540
6
7.3
6
86
5
52
18
44
18
18
1.87
124648--124730
6
13.8
6
87
5
96
1
27
33
37
1.65
134117--134160
23
1.9
23
95
0
79
34
15
20
29
1.94
135094--135118
13
1.9
13
100
0
50
48
0
0
52
1.00
146962--146999
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
147229--147399
93
1.8
93
92
0
288
28
28
21
21
1.99
147224--147396
46
3.7
46
78
10
199
28
27
21
21
1.99
147819--147878
30
2.0
30
86
0
84
33
25
5
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
149733--149801
30
2.3
30
84
2
102
57
14
4
23
1.55
151834--152009
50
3.5
50
85
0
235
36
15
22
25
1.93
151985--152102
31
3.8
31
93
0
191
27
20
27
24
1.99
152124--152261
49
2.8
49
86
5
174
30
13
24
31
1.93
161576--161625
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
166215--166264
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
166914--166938
7
3.6
7
100
0
50
56
0
16
28
1.41
176909--176941
6
5.5
6
92
0
57
15
30
36
18
1.91
183527--183567
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
200162--200274
35
3.3
35
64
16
92
42
5
13
38
1.67
200160--200289
67
1.9
67
93
0
224
44
6
12
36
1.67
200171--200305
67
2.0
67
86
0
189
46
7
11
34
1.69
202901--202992
26
3.8
24
72
19
75
65
4
0
30
1.12
233223--233279
30
2.0
28
83
13
71
38
1
21
38
1.64
234679--234725
21
2.2
22
81
11
62
10
2
29
57
1.44
234689--234725
11
3.5
11
79
20
51
8
0
32
59
1.27
235775--235984
41
5.1
41
87
2
262
35
21
22
20
1.96
235978--236061
17
5.3
16
70
20
52
53
23
1
21
1.53
235998--236031
17
1.9
18
94
5
61
64
17
0
17
1.29
236451--236503
21
2.5
21
77
20
56
35
0
33
30
1.58
236498--236608
14
7.7
14
71
16
59
21
1
35
41
1.64
236720--236763
16
2.6
17
82
7
54
52
2
2
43
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236732--236781
26
1.9
26
87
0
73
50
4
4
42
1.40
242710--242760
25
2.0
25
96
0
93
35
11
17
35
1.87
247887--248110
93
2.4
92
86
2
297
20
25
14
39
1.91
247887--248110
46
4.8
46
89
1
297
20
25
14
39
1.91
250235--250286
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
251564--252083
45
11.6
45
71
8
276
26
21
20
30
1.98
251795--251950
43
3.6
42
75
7
159
26
22
22
28
1.99
251708--251996
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3.3
88
85
1
346
26
21
21
31
1.98
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29
2.2
29
88
0
90
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3
30
31
1.74
256607--256812
55
3.8
53
78
10
211
34
18
26
20
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325