Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   

This is table  56  of  325  ( 38985 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20343046--20343296
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0
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20351423--20351529
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0
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19
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33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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12
100
0
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8
32
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
264
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0
70
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.70
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2.0
21
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57
19
0
4
76
0.96
20630713--20630788
23
3.3
23
69
7
66
47
0
3
48
1.20
20630771--20630802
12
2.6
13
90
9
50
37
0
0
62
0.95
20630792--20630831
21
1.9
21
84
0
53
35
2
5
57
1.34
20631038--20631080
18
2.4
18
84
0
59
60
0
6
32
1.23
20631106--20631163
7
8.4
7
77
11
66
31
0
0
68
0.89
20631191--20631255
23
2.8
25
82
15
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40
0
1
58
1.07
20631199--20631261
21
2.8
22
80
9
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42
0
3
53
1.16
20631229--20631293
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1.17
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0
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0
0
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0.97
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20
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20
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37
0
0
62
0.96
20631283--20631383
46
2.2
46
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2
2
53
1.31
20631560--20631604
22
2.0
23
86
4
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68
0
0
31
0.89
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19
2.6
15
75
25
50
37
6
0
55
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20631875--20631934
20
3.0
20
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56
0
1
41
1.09
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12
4.6
11
79
20
54
60
0
0
39
0.97
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79
3.1
76
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18
197
56
3
0
39
1.21
20631999--20632040
21
2.0
21
85
4
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76
4
0
19
0.96
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2
1
36
1.21
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3.2
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0
43
1.20
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0
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2.0
52
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28
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1.83
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28
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30
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1.21
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4
0
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1.18
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19
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0
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0
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40
0
0
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2.4
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40
0
0
60
0.97
20699125--20699187
24
2.8
24
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7
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41
0
1
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1.08
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23
2.0
23
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11
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42
1.60
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25
2.3
24
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50
8
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1.44
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54
0
0
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16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20715736--20716059
46
7.0
46
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2
445
22
24
14
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20721438--20721486
22
2.3
22
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10
57
51
0
2
46
1.12
20721409--20721534
59
2.1
58
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143
51
0
1
46
1.10
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21
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0
0
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1.00
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28
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2
0
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1.10
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0
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0
0
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0
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18
2.1
18
94
0
65
27
18
18
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325