Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  104  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33478939--33479351
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1.99
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1.99
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172
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0
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
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86
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3
2
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1.23
33552768--33552961
26
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26
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5
6
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1.9
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2.1
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0
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5
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3.2
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4
5
34
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33562923--33563086
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2.3
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1
70
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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1.9
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2.0
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27
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163
28
19
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156
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1.43
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10
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20
54
71
0
7
21
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33596622--33596675
15
3.3
15
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64
0
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1.20
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5
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53
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2
17
20
1.51
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51
2.6
51
96
1
237
24
21
21
32
1.98
33616450--33616489
20
2.0
20
90
5
62
7
22
15
55
1.65
33623017--33623086
34
2.0
35
97
2
133
37
24
14
24
1.92
33629724--33629776
22
2.4
22
93
0
88
30
11
3
54
1.53
33631099--33631181
24
3.4
25
79
9
75
40
18
20
20
1.91
33631141--33631187
25
1.9
24
82
4
58
36
17
23
23
1.95
33631194--33631282
26
3.4
27
76
13
89
34
20
24
20
1.96
33631748--33631797
26
1.9
26
87
0
73
40
16
0
44
1.47
33631757--33631787
16
1.9
16
93
0
53
41
12
0
45
1.42
33631754--33631797
5
8.6
5
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5
52
40
15
0
43
1.47
33633653--33633702
18
2.8
18
82
8
59
60
8
10
22
1.55
33636132--33636159
14
2.0
14
100
0
56
64
21
7
7
1.43
33636141--33636241
51
2.0
51
82
5
125
64
11
10
12
1.50
33641029--33641082
20
2.6
21
82
11
67
35
0
7
57
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33641072--33641099
11
2.5
11
100
0
56
28
0
0
71
0.86
33642734--33643166
46
9.4
46
89
2
629
40
14
22
22
1.90
33644319--33644366
25
2.0
25
95
4
89
70
22
2
4
1.15
33664049--33664216
24
6.8
24
69
8
70
33
22
24
19
1.97
33664263--33664317
24
2.3
24
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6
76
27
18
36
18
1.94
33664819--33664858
20
2.0
20
85
0
53
37
20
0
42
1.52
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24
3.1
23
71
15
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61
2
1
34
1.19
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24
2.0
24
100
0
98
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24
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34
1.75
33671002--33671026
13
1.9
13
100
0
50
32
0
16
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1.44
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13
2.3
14
94
5
55
54
3
0
41
1.16
33687164--33687209
21
2.2
21
96
3
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39
15
10
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12
2.1
12
100
0
50
60
8
8
24
1.52
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21
2.7
20
88
8
83
31
5
3
59
1.38
33695496--33695520
7
3.6
7
100
0
50
28
0
12
60
1.32
33696017--33696115
30
3.3
30
87
2
146
31
43
17
8
1.78
33696021--33696096
15
5.2
13
74
22
71
31
43
15
9
1.79
33696172--33696209
18
2.1
18
90
0
58
21
26
7
44
1.79
33700403--33701530
126
9.0
126
94
0
1887
25
19
19
35
1.95
33701652--33701724
19
3.8
19
78
7
67
45
20
2
31
1.65
33701793--33701838
21
2.2
21
96
0
83
50
32
0
17
1.47
33702427--33702471
15
2.9
16
83
6
65
42
8
0
48
1.34
33704245--33704306
19
3.2
19
75
8
54
59
3
0
37
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33704529--33704572
16
2.8
17
78
21
51
27
25
6
40
1.80
33706642--33706707
3
21.3
3
76
17
64
65
0
34
0
0.93
33706644--33706711
14
5.2
13
75
15
61
64
0
35
0
0.94
33706665--33706703
8
4.9
8
84
9
53
69
0
30
0
0.89
33707218--33707286
15
4.4
15
74
13
59
71
2
7
18
1.23
33707252--33707284
17
1.9
17
93
0
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72
0
12
15
1.12
33707364--33707627
119
2.2
118
87
4
368
56
9
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27
1.54
33707595--33707659
13
4.7
13
75
14
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1
3
21
1.05
33707597--33707657
30
2.1
29
90
3
95
72
1
3
22
1.09
33710376--33710459
26
3.1
26
72
24
91
47
13
2
36
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325