Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  58  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Number
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Indels
Score
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24
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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2.1
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20
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
21382864--21382927
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35
84
1
291
30
24
15
30
1.95
21405463--21405591
46
2.8
45
86
5
170
30
5
21
42
1.75
21409056--21409081
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
21428993--21429017
7
3.6
7
100
0
50
12
0
0
88
0.53
21429971--21430037
28
2.3
29
84
5
82
62
1
4
31
1.24
21434558--21434597
11
3.9
11
78
15
50
25
2
0
72
0.97
21437522--21437546
6
4.2
6
100
0
50
0
16
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32
1.44
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19
1.9
19
100
0
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21455673--21455697
13
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0
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0
8
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0
0
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12
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12
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2
1.69
21468161--21468199
16
2.5
15
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8
51
61
0
0
38
0.96
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17
2.1
17
100
0
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30
41
0
27
1.56
21473779--21473814
10
3.6
10
92
7
56
19
8
0
72
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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34
0
2
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1.08
21474213--21474262
25
2.0
25
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32
2
4
62
1.25
21476281--21476325
19
2.4
19
85
7
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20
22
15
42
1.89
21480624--21480751
64
2.0
64
85
0
175
28
14
16
40
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29
1.97
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31
18
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28
1.97
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134
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0
0
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17
0
2
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21
2.0
20
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35
0
2
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1.09
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2.1
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0
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0
0
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1.00
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0
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1.12
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1
0
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1.09
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2.0
26
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56
4
2
38
1.30
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7
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7
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0
2
44
1.12
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31
2.5
32
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0
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39
1.17
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36
3.6
33
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135
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2
1
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1.22
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21
2.0
20
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2
0
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9
5.2
9
78
14
53
77
0
2
20
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21488888--21488930
13
3.2
13
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3
59
76
2
0
20
0.89
21488952--21489010
13
4.3
13
75
12
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1
10
6
0.94
21488893--21488978
37
2.3
37
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100
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2
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1.00
21488952--21489011
12
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80
1
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10
0
50
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28
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0
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5
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0
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1.15
21508003--21508067
20
3.3
19
77
12
60
60
1
1
36
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325