Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  102776486

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   

This is table  321  of  325  ( 38985 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101107140--101107179
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1.9
21
100
0
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10
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1.72
101107482--101107558
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2.1
19
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5
0
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1.21
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15
55
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0
1
37
1.07
101109184--101109242
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3.4
17
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6
73
61
0
1
37
1.07
101109228--101109252
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0
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0
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57
1.12
101109945--101110017
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1
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2.6
101
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0
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1.95
101122143--101122400
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5.1
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2.0
217
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2.1
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0
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29
2.1
29
100
0
122
55
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11
22
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101171546--101171752
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3.1
66
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2
371
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25
2.00
101175402--101175454
25
2.1
25
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0
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11
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1.70
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2.2
35
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2
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11
20
1.54
101209302--101209377
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2.5
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100
0
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101209833--101209872
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0
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2
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1.66
101211463--101211496
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101215668--101215736
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25
27
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2.9
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301
25
28
16
29
1.97
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23
19
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9.9
44
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10
271
29
25
14
30
1.95
101216557--101217216
219
3.0
218
81
5
704
28
24
16
31
1.96
101216991--101217233
131
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129
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3
371
28
25
14
30
1.95
101218186--101218238
7
7.9
7
78
4
56
3
9
1
84
0.81
101218185--101218234
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1.9
26
88
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6
10
2
82
0.92
101223936--101224011
22
3.7
21
75
15
59
40
17
5
36
1.72
101223972--101224116
19
7.9
19
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9
221
37
14
9
37
1.79
101223978--101224116
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2.6
54
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1
251
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14
9
38
1.78
101229566--101229599
6
5.7
6
92
0
59
14
32
50
2
1.58
101230032--101230258
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1.8
124
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4
294
45
10
5
37
1.63
101230742--101230808
9
7.0
9
72
12
53
34
2
2
59
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101241497--101241756
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7.4
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3
256
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15
27
1.87
101241503--101241756
70
3.6
70
79
2
285
42
14
15
27
1.87
101241522--101241756
105
2.2
105
86
0
326
41
14
16
27
1.87
101243806--101243842
14
2.5
14
91
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56
21
16
5
56
1.59
101243805--101243842
15
2.4
16
86
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60
21
15
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57
1.57
101244174--101244220
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2.0
23
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0
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40
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1.89
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2.0
248
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101300174--101300248
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101312031--101312108
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43
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101312117--101312212
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2.3
40
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3
147
63
8
28
0
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101318315--101318355
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29
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0
0
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40
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3.5
28
77
10
94
63
8
0
28
1.23
101337100--101337133
9
3.7
9
88
7
50
67
5
0
26
1.13
101337139--101337194
22
2.5
23
80
16
64
71
1
0
26
0.96
101337152--101337195
23
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24
90
9
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72
2
0
25
0.96
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1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
101344325--101344523
99
2.0
99
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0
398
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14
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1.88
101359179--101359409
46
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46
90
2
320
19
23
15
41
1.89
101361959--101362016
23
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23
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0
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2
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2
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0
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50
0
50
1.00
101366420--101366454
6
5.8
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0
70
17
17
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0
7
15
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59
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0
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2.0
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3
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0
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0
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28
2.8
28
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1
1
60
1.13
101388979--101389073
38
2.5
38
75
0
100
34
27
7
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
19
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35
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17
1.88
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13
2.1
14
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37
3
20
37
1.70
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3.5
11
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14
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10
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1.71
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32
2.2
33
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30
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0
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2.0
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32
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3
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1.23
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19.0
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2
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18
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2
2
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1.22
101423376--101423434
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0
1
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2.3
23
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54
12
11
11
64
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101425141--101425182
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1.9
23
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0
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3.2
13
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2
0
33
1.08
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0
0
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0.90
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0
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2.5
21
81
0
70
16
28
24
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325